"מבחינה מקצועית, יש מקום שבתי הדין הרבניים יעברו לאחריות משרד המשפטים, כמו שאר בתי המשפט ובתי הדין... יחד עם זאת, צריכה להישמר זיקה מוסדית לרבנות הראשית לישראל". כך אמר (שבת, 11.10.03) היועץ המשפטי לממשלה, אליקים רובינשטיין, בתוכנית 'חוק וצדק' בערוץ 33 של רשות השידור.
רובינשטיין הדגיש, כי מדובר בדעתו האישית, הנאמרת מבחינה מקצועית בלבד, מאחר ו"הויכוח קיבל צביון פוליטי כזה, שאיני רוצה להיכנס אליו וודאי שאיני רוצה לנקוט צד".
"יחד עם זאת", הדגיש היועץ, "מאחר והרבנים הראשיים הם גם חברי בית הדין הגדול, אז צריך להיות קשר וזיקה, וסוג של מגע מוסדי בין הרבנות ובתי הדין הרבניים. לגבי זהותו של השר, אין מה להיכנס לזה, כי הרי שר בא ושר הולך. זו שאלה מוסדית".
כשנשאל לגבי מנהגו לפרסם דוח ציבורי, שמצורף להחלטה שלא להעמיד לדין איש ציבור (כפי שעשה לגבי בנימין נתניהו בפרשת 'בר-און חברון', וכן לגבי עזר ויצמן וצחי הנגבי), השיב: "אני ער לבעייתיות שבכך. אבל ראשית, היה לאדם יומו בחקירה, כי הוא כבר נחקר. שנית, זו חובתי. אם לא אכתוב את הדוח הציבורי, יעתרו נגדי לבג"צ, ואז איאלץ לתת בתגובה לבג"צ את הדוח הציבורי. מטרתו [של הדוח] היא לנמק את ההחלטה שלי לסגור את התיק. בית המשפט אמר כבר שאם הפרקליטות והיועמ"ש מוצאים לנכון לנמק את החלטתם, זה לגיטימי וראוי".
עוד הוסיף, כי הוא בוחר בקפידה את דבריו בדוח הציבורי: "אפשר להתווכח על ניסוחים. אני עושה זאת אחרי התלבטות רבה על הניסוח ואני גם מביט על הביקורת. אני קשוב למי שמבקר, אבל בגדול, זה סוג של הנמקה שיש לעשותה בשקילות ובזהירות. אתה כ'ספר הפתוח' בפני הציבור וצריך לנמק החלטות. התקופות השתנו. האם אפשר להשוות את המצבים הציבוריים, את החשיפה והשקיפות, כל הבעייתיות שיש לה פנים חיוביות וגם אחרות, בין השנים של לפני 30 שנה ובין היום? זה עולם אחר בכלל. גם פרקליטות המחוז נותנת היום הנמקה רחבה יותר להחלטותיה. יש יותר שימוע מאשר בעבר, ולא רק לאנשי ציבור".
כשנשאל בעניין בקשתו להמשיך את הדיון בעתירה שהוגשה נגד יו"ר ועד עובדי חברת החשמל שנפטר לאחרונה, יורם אוברקוביץ', השיב: "כמו בכל דבר, גם על זה אפשר להתווכח. זו לא היתה בקשה שלנו, אנחנו הודענו שאנו תומכים בבקשה. היתה כאן שאלה עקרונית, שכלל לא קשורה לאוברקוביץ'. השאלות שם קשורות להתנהלות חברות ממשלתיות, ואני מציע לכולנו שנביט נכוחה בעובדות. זהו הוצג לציבור כהתעסקות ביורם אוברקוביץ' עליו השלום. לא מיניה ולא מקצתיה! מתעסקים בשאלה איך מתנהלת חברה ממשלתית, בעניינים הקשורים בטוהר המידות".
באשר לדיון הציבורי בשאלת 'הסיכול הממוקד', אמר היועץ כי תפקידה של הפרקליטות הוא כפול: "פנימה, אנחנו בדיאלוג נוקב עם גורמי הביטחון, עם הצבא והשב"כ, על דרך הפעולה לפי החוק. מצד שני, אנחנו צריכים להגן על המערכת מפני עלילות, וכמו שהיה בג'נין, שאמרו שהיה טבח והיינו צריכים להיאבק בכך חודשים. הסיכול הממוקד אינו הדבר האהוד ביותר על שום אדם מהיישוב, אבל כשיש לך אויבים מהסוג הזה, וזה בא לידיעתנו, וזה גם עמד כבר בבג"צ, אנחנו קבענו כללים והם מקויימים".
רובינשטיין הוסיף, כי "אנחנו רואים במוחש איך משתדל צה"ל [להימנע מפגיעה באזרחים פלשתיניים], וישבו אצלי יום אחרי הניסיון לפגוע בראשי החמאס בעזה, והראו לי אחת לאחת, איך החליטו על פצצות קטנות יותר, בגלל החשש לפגוע באזרחים, ולכן גם ניסיון הפגיעה נכשל. המאמץ נעשה כי אנו רואים את מדינת ישראל כמדינה יהודית ודמוקרטית, ומדינה שומרת חוק".