הרב אליהו בקשי-דורון, שהיה הראשון לציון והרב הראשי לישראל, מואשם במאות עבירות מירמה בפרשת תארי הרבנים. כתב האישום נגד הרב בקשי-דורון הוגש (יום ב', 24.12.12) לבית המשפט המחוזי בירושלים.
כתב האישום מתייחס לפעילותו של הרב בקשי-דורון בעת כהונתו, בשנים 2003-1993, כאשר שימש כנשיא מועצת הרבנות הראשית. באותה תקופה אפשרו צה"ל, המשטרה ושירות בתי הסוהר למשרתים בשורותיהם לקבל תוספת שכר של 4,000-2,000 שקל לחודש בגין הסמכה לרבנות. כדי לקבל תוספת זו, נדרשו המשרתים בכוחות הביטחון להציג תעודות מן הרבנות בדבר השכלה תורנית גבוהה.
לצורך הלימודים לבחינות הרבנות, הוקמו בשנים 2003-1999 ברחבי הארץ מכללות רבות ללימודים תורניים. חלקן היו בראשות אישים מובילים בעולם הרבני: הרב דוד יוסף, בנו של הרב
עובדיה יוסף; הרב יוסף אליהו, בנו של
הרב מרדכי אליהו; הרב הראשי לחיפה דאז, הרב שאר-ישוב הכהן; הרב יהודה דרעי, הרב הראשי לבאר שבע ואחיו של
אריה דרעי.
לטענת המדינה, בפועל, הלימודים במכללות אלו היו חלקיים ביותר ורחוקים מן הדרוש לעמידה בכללי הרבנות ובבחינותיה. הרב בקשי-דורון ידע על מצב זה, ובישיבה באוקטובר 1999 אף ציין, "כי הובא לידיעתו כי יש בין הלומדים מי שלא סיימו בי"ס תיכון ובודאי שלא תיכון דתי, וכי רבים מהלומדים כלל אינם שומרי מצוות וחלקם מחללים שבת". באותה ישיבה גם הביע הרב בקשי-דורון את חששו, שהענקת תעודות השכלה תורנית גבוהה לבוגרי מכללות אלו תביא לזילות של תעודות הרבנות בכלל.
למרות כל אלו, נטען בכתב האישום, הינחה הרב בקשי-דורון את מנהל מחלקת הבחינות וההסמכה ברבנות הראשית, הרב יצחק אוחנה (שהיה בן-אחותה של הרבנית בקשי-דורון והובא לרבנות בידי הרב) לנפק את התעודות לבוגרי המכללות. בעקבות זאת הוצאו מאות תעודות כאלו, אשר עלו לקופת המדינה בתוספות שכר של מאות מיליוני שקלים שהוצאו ממנה במירמה. "הנאשם עשה כן בשל שאיפתו להימנע מעימות עם גורמים מרכזיים במועצת הרבנות הראשית ובעולם הרבני בכלל, הלא הם אלה שהפעילו ונתנו את חסותם למכללות", נאמר בכתב האישום.
המדינה מייחסת לרב בקשי-דורון מאות עבירות של קבלת דבר במירמה בנסיבות מחמירות, מאות עבירות של ניסיון לקבל דבר במירמה בנסיבות מחמירות, מאות עבירות של מתן תעודה כוזבת וכן מירמה והפרת אמונים.