בשבוע הבא (24.12.13) אמורה להתחיל לפעול רכבת לשדרות, שתחבר את העיר וסביבותיה לתל אביב.

תחנת הרכבת בשדרות הוקמה בעלות של כ-50 מיליון שקלים. זוהי תחנת הרכבת הראשונה בארץ הממוגנת מפני טילים. התחנה כוללת טרמינל נוסעים חדיש, רציפי נוסעים באורך של כ-300 מטר, שלוש מסילות ברזל ומעברים תת-קרקעיים ועיליים. בצמוד לתחנה נבנה מגרש חניה ל-400 כלי רכב. במסגרת המיזם מוקמת טיילת, הכוללת שביל להולכי רגל ולאופניים, באורך של יותר מקילומטר, ממכללת ספיר ועד לתחנה.

על-פי החלטת שר התחבורה, תושבי שדרות, נתיבות ואופקים והמועצות האזוריות סביבן (שדות נגב, שער הנגב, מרחבים, אשכול ובני שמעון) וכן סטודנטים הלומדים במכללת ספיר יהיו זכאים לנסוע ברכבת משדרות לכל חלקי הארץ ובחזרה, ללא כל תשלום, במשך שלושה חודשים מיום פתיחתה. עם זאת, ההטבה אינה ניתנת לתלמידי ישיבת שדרות ולחברי גרעיני משימות המשרתים באיזור.

הנסיעה תתאפשר רק לבעלי כרטיס רב-קו. ניתן יהיה להנפיק כרטיס חכם בתחנת הרכבת בשדרות.

בסוף שנת 2014 צפויה רכבת ישראל לחבר גם את נתיבות ואופקים לרשת המסילות הארצית, במסגרת הקמת קו הרכבת אשקלון-באר שבע. פרויקט שעלותו נאמדת ביותר משני מיליארד שקלים.