מבקר המדינה,
יוסף שפירא, מצא ליקויים מהותיים בפרויקט מאגר המידע הביומטרי והנפקת תעודות הזהות החדשות במסגרתו. כך מוסר (יום ד', 15.4.15) משרד המבקר.
שר הפנים היוצא,
גלעד ארדן, הודיע השבוע, כי בכוונת המשרד לחייב את כל אזרחי ישראל להמיר את תעודות הזהות שבידיהם לתעודות הביומטריות. הפרויקט עורר התנגדות רבה מצד מי שטוענים, כי המאגר עלול להיות פרוץ וכך ידלפו - כולל לגורמים עברייניים וחבלניים - פרטיהם האישיים של תושבי ישראל.
שפירא שיגר מכתב לראש הממשלה,
בנימין נתניהו, ולארדן לגבי דוח ביקורת בנושא "תיעוד לאומי ביומטרי - תקופת המבחן", שנשלח אליהם לפני פרסומו. במכתבו מציין שפירא, כי מאחר שהדוח "מעלה ליקויים מהותיים ולדברים משמעות ציבורית מרחיקת לכת ורגישות רבה", הוא מבקש מהם להביא לידיעתו בהקדם את הפעולות שנעשו לתיקון הליקויים שהועלו בדוח, וזאת בטרם יתחיל הליך החקיקה בנושא.
משרד מבקר המדינה מסר עוד, כי ככל הנראה הדוח במלואו לא יפורסם, בשל משמעויותיו הביטחוניות. המשרד פנה בנושא ליו"ר ועדת ביקורת המדינה בכנסת ה-19, ח"כ
אמנון כהן, שכן הוועדה היא המוסמכת על-פי החוק להטיל חיסיון מלא או חלקי על דוחות המבקר.
הרשות לניהול המאגר הביומטרי במשרד הפנים מסרה בתגובה, כי מכתבו של מבקר המדינה מתעלם מהעובדה שהליקויים עליהם הצביע תוקנו, וכי הדברים מפורטים בדוח המסכם שהוגש לכנסת. "על-פי לשון החוק, הדוח המסכם הונח על שולחן הכנסת אשר אמורה לדון בו בפרוצדורה קבועה ומוגדרת. הניסיון של המבקר לעצור את התהליך אשר נקבע בחוק אינו ברור. תקופת המבחן נקבעה בחוק על-מנת לבחון את המערכת ולתקן ליקויים ככל שיימצאו.
"לאורך תקופת המבחן, נבדק פרויקט התיעוד הלאומי הביומטרי על-ידי מבקר המדינה. העובדה שהבדיקה בוצעה בזמן אמת אפשרה לרשות לתקן את הליקויים עליהם הצביע המבקר כבר במהלך תקופת המבחן. הדוח המסכם אשר הוגש על-ידי השר כולל התייחסויות מפורשות לליקויים ומפרט את האופן בו תוקנו".