כמעט שנה לאחר הגשת כתב האישום נגד הרב יונה מצגר, גילתה המדינה שלא העבירה לסניגוריו 1,000 מסמכים מתוך חומר החקירה. כך מסרו (יום א', 18.9.16) סניגוריו של הרב הראשי לשעבר לבית המשפט המחוזי בירושלים.

לדברי עוה"ד טופז איתן וטל גבאי, הם קיבלו מהפרקליטות באמצעות הדוא"ל 1,000 מסמכים שמתוך שגגה לא הועברו להם קודם לכן, וגם לא נכללו בדיסק בו נצרב חומר החקירה. עוד הם טוענים, כי לפחות ארבעה קלסרים נעדרים מהרשימה השנייה של חומר החקירה שקיבלו בימים האחרונים. השוואת הרשימות השונות אף העלתה, הם ממשיכים, כי קלסרים נוספים טרם הועברו לידיהם.

"העובדה, כי מסמכים רבים מתגלים בשל עתירה לרשימת חומרי חקירה מדאיגה ביותר, ומלמדת על העובדה שהרשימה נערכה לפי החומר הקיים במשרדי הפרקליטות ולא על-פי החומר שנאסף ביחידה החוקרת", טוענים איתן וגבאי.

לדבריהם, הרשימה השנייה שמסרה המדינה אינה רשימה של חומרי חקירה, שכן היא אינה מתייחסת לאף אחד מהפריטים החסרים עליהם הצביעו בשבוע שעבר, ובראשם רוב הודעותיו של עד המדינה ו-60 עדויות נוספות שגבתה המשטרה. הסניגורים מבקשים מהשופט משה יועד הכהן לקיים דיון בנושא או לתת כל סעד שימצא לנכון.