שר הביטחון בנט הנחה את משרד הביטחון לסייע למשרד הבריאות ברכש ציוד רפואי ואמצעים תברואתיים, בדגש על אמצעי טיהור ניידים, לצד סיוע באספקה אווירית של הציוד מחו"ל, והמשך מאמצי מחקר ופיתוח (מו"פ) לבחינת הישרדות הנגיף וגיבוש אמצעי התמודדות. בנוסף, הוצגו בפני השר תרחישים שונים של החמרה במשבר ואופן ניהולם על-ידי מערכת הביטחון במידת הצורך. בהתאם להמלצת כלל הגורמים, הוחלט כי בשלב זה לא יוטל סגר גורף על שטחי הרשות הפלשתינית, והסגר יפוג כמתוכנן עם תום ימי הפורים, כפוף להערכת מצב עדכנית. בנוסף, הנחה בנט את היחידה לתיאום פעולות הממשלה בשטחים (מתפ"ש), לגבש מודל בידול בין האוכלוסיות ברש"פ עליהן יוטל סגר, זאת על-מנת למנוע פגיעה משמעותית במשק הישראלי והפלשתיני.