הממשלה דנה (יום א', 28.3.04) בערעור שר הפנים על החלטת ועדת השרים לעניין הקמת ישובים חדשים ופיתוח הישובים הקהילתיים בנגב ובגליל. השר פורז ערער על ההחלטה מיום ה-16.2.2004, לאשר הקמת ישוב קהילתי 'כפר המדע' בנגב. לערעור זה, הצטרפו גם השרה לאיכות הסביבה, יהודית נאות, ושרת החינוך, התרבות והספורט, לימור לבנת.
בנוסף, התקבלו ערעורים לעניין קרבת הישוב ל'מכתש הגדול' והצורך להרחיק הפיתוח משמורת הטבע. עמדתו של השר פורז חוזקה, בדיון בידי היועץ המשפטי לממשלה, מני מזוז, שציין, כי אין לקבוע נקודת ציון מדויקת להקמת ישוב ובכך לכבול את מוסדות התכנון.
בערעורו טוען השר פורז, כי אל לממשלה לקבוע נקודת ציון מדויקת להקמת ישוב ובכך, להכתיב החלטה למוסדות התכנון. על הממשלה לקבוע מדיניות, במקרה זה בדבר פיתוח ירוחם וסביבתה, והתכניות המפורטות ייבחנו במוסדות התכנון.
כמו כן, ועדת השרים אינה יכולה לקבוע את דרך קביעת השיוך המוניציפלי של הישוב באופן מפורט. סמכות זו נמצאת בידי שר הפנים.
ועדת השרים קבעה מספר שלבים בנוגע לשיוך המוניציפלי: "בתום חמש שנים מאיכלוס שלב ב', יצורף הישוב לתחום השיפוט של ירוחם" - דהיינו 550 יחידות דיור. לטענת, פורז, שלבים אלה אינם סבירים, שכן הישוב לא יגיע ל-550 יחידות דיור בטווח הנראה לעין ולא יצטרף לירוחם.
כמו כן, יש לבחון היטב במוסדות התכנון, את מיקומו של הישוב לאור קרבתו המוצעת ל'מכתש הגדול' - אזור נוף חשוב ביותר המשמש כשמורת טבע.
ראש הממשלה, אריאל שרון, הודיע כי הוא מייחס חשיבות רבה לישוב הנגב, אולם מאחר שנשמעו הערות רבות לגבי היבטים חברתיים וסביבתיים, הוא מציע להחזיר הנושא לוועדת השרים לשם דיון נוסף.
שר הפנים הביע סיפוק מכך שהערעור התקבל למעשה ומסר, כי משרד הפנים יגיש לוועדת השרים חלופות נוספות למיקום הישוב ושלבי פיתוחו.