הרב הראשי לשעבר, הרב אברהם שפירא, שלח (יום א', 7.8.05) לרב הצבאי הראשי, תא"ל ישראל וייס, מכתב ובו מחה על ריאיון שפורסם עימו בשבועון "במחנה" בו טען הרב וייס, כי בשום שלב של השיחה שקיים עם הרב לא דרש ממנו הרב שפירא לפשוט את מדיו. הרב שפירא התקומם על אמירה זו, ודרש במכתבו מהרב וייס שלא לעשות שימוש בשמו. מלשכת הרב וייס נמסר, כי אין בכוונתם להגיב על תוכן המכתב באמצעות אמצעי התקשורת.
להלן נוסח המכתב השלם:
לכבוד מכובדנו, הרב הראשי לצה"ל, תא"ל ישראל וייס שליט"א
נתגלגל לידי עיתון במחנה ובו ראיון עם הרה"ר לצה"ל.
נשתוממתי עד מאוד על תוכן הדברים, אשר, לעניות דעתי, אינם עולים בקנה אחד עם רצון התורה. אולם, לא משום כך טרחתי לשלוח אליך מכתבי זה, אלא משום הניצול הציני ושרבוב שמי בנוגע להנהגותיך והוראותיך לחיילים. אמירה שכזו כי הרב ש' (שפירא; ע.י.) לא הורה לי לפשוט את מדי, והוא יודע את דעותי, וכו' וכו', הוא מעשה לא ראוי.
הרי הבהרתי לך במענה לשאלתך באותה פגישה, כי לעניות דעתי אסור בשום אופן להיות שותף או לסייע בגירוש יהודים מביתם, בהריסת בתי כנסת, ובפגיעה בקברים, וגם רב צבאי בכל דרגא שהוא מוזהר בדברים אלו, שהם אסורים על-פי ההלכה.
שימוש בשמי כאילו אני מסכים למעשיך בנושא זה אינו נכון. ידוע לך במפורש מאותה פגישה ולאחר מכן, כי לדעתי אסור גם לרב צבאי לעבור על דברי תורה. ונתינת הכשר לגירוש יהודים הרי זה חילול השם.
אם כפי שאתה טוען שאתה תלמידי, בבקשה ממך תשמע לדעתי ולא תורה הפוך ממני, ואם אינך כך, אל נא תשתמש בשמי למילוי משימותיך.
כדאי להיזכר בדברי חז"ל, יש קונה עולמו בשעה אחת. ויש מאבד עולמו בשעה אחת. אל תהיה שותף לדבר עבירה! כולנו תפילה כי זכות תפילות של ישראל ומסירות נפשם למען ארץ-ישראל, יבטלו מעלינו כל גזירות קשות ונתבשר בבשורות טובות וישועות.
בברכה וכל טוב סלה. הרב אברהם שפירא