המשבר בין ישראל לוותיקן יושב בימים אלה, לאחר שראש הממשלה, אריאל שרון, שיגר איגרת אל האפיפיור, בנדיקטוס ה-16, ובו הגדירו: "ידיד אמת של ישראל".
שגריר ישראל בוותיקן, עודד בן-חור, הוא שהגיש את האיגרת למזכיר הוותיקן, הקרדינל אנג'לו סודאנו. לסוכנות AP נמסר, כי הצדדים - ישראל והוותיקן, רואים בזאת סיום המחלוקת בין הצדדים.
באיגרתו שיבח שרון את העמדות בהן נוקט האפיפיור, לרבות מחוייבותו לפעול נגד האנטישמיות, פיוס והבנה בין המדינות.
המשבר פרץ מיד לאחר הפיגוע בנתניה (יולי 2005), בעת שהאפיפיור גינה את הפיגועים שאירעו בלונדון ובערים אחרות בעולם, ו"שכח" לגנות את הפיגוע שבוצע בנתניה. משרד החוץ, ובראשו השר סילבן שלום, הוא שמתח ביקורת על האפיפיור - נטען כי האפיפיור נמנע בכוונה - ובכך מתיר, כביכול, פיגועים מצד הפלשתינים נגד ישראלים.
בוותיקן הדפו את הביקורת. נטען, כי האפיפיור
אינו מקבל הוראות מאיש. במקביל, מיאנו להסתפק בהבהרות/התנצלות מצד משרד החוץ, ולכן נדרש ראש הממשלה לשגר את האיגרת דנן.
עתה, נוכח סיום המשבר, נסללה הדרך מחדש לפגישת בכירים מישראל עם נציגים בכירים בוותיקן. באמצע ספטמבר עומדים שני הרבנים הראשיים לישראל להיפגש עם האפיפיור.