משרד התחבורה אישר לרכבת ישראל תקציב חריג של 11 מיליון ש"ח, לתיגבור מערך האבטחה של הרכבת ולמיגון מסילות הברזל.
שר התחבורה אפרים סנה מסר, כי הסכום שאושר יושקע בהתקנת מערכות הגנה על גשרים, לאורך הצירים של מסילות הברזל, וכן בגידור תוואי מסילת הברזל באזורים רגישים וסביב כל תחנות הרכבת. כמו כן יותקנו מצלמות במעגל סגור לאורך מסילת הברזל, שיעבירו אינפורמציה למרכז בקרה על ניסיונות פיגוע במסילה.
שר התחבורה מסר, כי בנוסף לכך יושקעו מידי שנה כ-8 מליון שקל נוספים בשידרוג האבטחה בתחנות הרכבת. בין השאר, יוחלפו כל הבודקים הביטחוניים בתחנות הרכבת, במאבטחים חמושים.
סנה ציין, כי תחנות הרכבת ומסילות הברזל הפכו לאחרונה יעד לניסיונות פיגוע מצד ארגוני טרור. לדבריו, תיגבור מערך האבטחה יסייע למנוע פיגועים המוניים בנוסעי הרכבת.
לפני כשבועיים התפוצץ מטען חבלה מתחת לרכבת נוסעים שחלפה ליד שכונת גני אביב שבעיר לוד. ביולי 2001 נהרגו 2 חיילים בהתפוצצות מחבל מתאבד בתחנת אוטובוס הסמוכה לתחנת הרכבת בבינימינה, ובספטמבר 2001 נהרגו 3 בני אדם, כשמחבל מתאבד התפוצץ ביציאה מתחנת הרכבת בנהריה. בנוסף לכך התפוצץ מטען חבלה על מסילת הרכבת שליד קיבוץ מעגן מיכאל.