עם תום תפילת השישי החלו ערבים במתחם ליידות אבנים לעבר כוחות המשטרה, כחלק מהמחאה על כך שלטענתם יהודים קיללו את אבי האיסלאם מוחמד במהלך צעדת הדגלים.
לאחר תפילת הצהריים, החלה תהלוכה של כמה מאות ערבים לעבר שער השלשלת. בסיומה ועם תחילת הפיזור של המתפללים אל מחוץ להר, החלו כמה עשרות צעירים להפר את הסדר ולידות אבנים לעבר השוטרים המוצבים בכניסה להר.
עם סיום יציאת המתפללים מהר-הבית, מפקד מחוז ירושלים, ניצב דורון תורג’מן שנמצא במקום ומפקד על הכוחות, הורה לשוטרים לאתר חשודים המעורבים בהפרת הסדר וידוי אבנים. 16 חשודים נעצרו והם הועברו להמשך החקירה.