מנהיגה הרוחני של שס, הרב
עובדיה יוסף, מודה לראשונה כי תפקיד יושב-ראש שס אמור היה להיות מלכתחילה של
אריה דרעי ומי שאמור היה להיות מוצב בראש הרשימה לכנסת לא היה צריך להיות
אלי ישי.
בשיעורו השבועי במוצאי-שבת, אמר הרב יוסף: "הרב אריה דרעי, הוא היה מייסד התנועה. עשר שנים בערך הוא היה שר הפנים והיטיב לכל הישיבות בלי הבדל ספרדים-אשכנזים; היה תומך בכולם. הגאון הרב שך אמר בפיו: יש לנו צעיר אחד ספרדי, שעשה מה שלא עשו אגודת ישראל ארבעים שנה".
"עץ חיים היא למחזיקים בה ותומכיה מאושר. גרם מה שגרם, לקחו אותו לבית סוהר, וכשיצא לא היה מותר להחזיר אותו, למה (כי) היה חוק. לפני כמה חודשים עבר הזמן שמותר כבר להחזיר אותו".
הוא התייחס להחלטת מועצת חכמי התורה בנשיאותו ואמר: "לפני שנכנס לכלא הבטחתי לו שפקדונו בידינו. הוא היה עוד קודם לכן החזרנו לו. תדונו אותנו לכף זכות, וה' ידין אתכם לכף זכות".
על היו"ר המודח אמר: "ידידינו, רבי אליהו ישי, איש צדק וישר, בכל ביתי נאמן הוא, אף פעם לא התרגז, כל מה שעשה הצליח. אני אסיר תודה, עשה הכל בחכמה וענווה, אף פעם לא התרברב, לא התנשא. אני מודה לו על כל מה שעשה ה' ימלא ימיו ושנותיו בטוב ובנעימים".
הרב יוסף לא הסביר מדוע לכתחילה העמידה מועצת החכמים שלושה יושבי ראש, מדוע לא השאירה המועצה את המצב על-כנו, היכן הייתה הטעות, ומדוע לא הוחזר הפיקדון לדרעי מיד אחרי הבחירוץ