משטרת ישראל ממליצה להעמיד לדין בפרשת הרפז את הרמטכ"ל לשעבר, רב-אלוף (מיל.)
גבי אשכנזי; את מזכיר ה
ממשלה, אלוף (מיל.)
אביחי מנדלבליט; את דובר צה"ל לשעבר, תת-אלוף (מיל.) אבי בניהו; ואת רל"ש הרמטכ"ל לשעבר, אל"ם (מיל.)
ארז וינר. המשטרה מייחסת להם מגוון עבירות: מרמה והפרת אמונים, שיבוש הליכי משפט, חשיפת מידע סודי בפני מי שאינו מוסמך לכך, וסיכון בטחון המדינה בשמירה על מסמכים סודיים באופן שאינו מורשה.
ההמלצות הועברו לפרקליטות עם סיום החקירה של יחידת להב 433, שהחלה על-רקע פרשת המסמך שזייף
בועז הרפז ואשר התיימר להציג תוכנית למינויו של
יואב גלנט לרמטכ"ל במקום אשכנזי. החקירה גילתה תככים ויחסים עכורים הדדיים בין לשכתו של אשכנזי לבין לשכתו של שר הביטחון דאז,
אהוד ברק.
באוגוסט 2013 החליט היועץ המשפטי לממשלה,
יהודה וינשטיין, על פתיחה בחקירה פלילית, לאחר שבמשך שנתיים נמנע מלעשות זאת למרות פניותיו של
מבקר המדינה דאז,
מיכה לינדנשטראוס, שבדק את הפרשה ופרסם דין וחשבון חמור עליה.
במסגרת החקירה נחקרו עשרות מעורבים, חלקם באזהרה, ובוצעו מגוון רחב מאוד של פעולות חקירה, לרבות טיפול בהיקף נרחב מאוד של חומרים אשר נאספו על-ידי מצ"ח, על-ידי מבקר המדינה ובמהלך החקירה הנוכחית. עם תום החקירה אימץ ראש האגף לחקירות ולמודיעין, ניצב מני יצחקי, את עמדת ראש יאח"ה בנוגע לכלל ממצאי החקירה. להלן עיקרי החשדות והממצאים.
זיוף המסמך החקירה בנוגע למסמך הרפז גיבשה תשתית ראייתית נגד סא"ל (מיל.) בועז הרפז לביצוע עבירות זיוף בנסיבות מחמירות ושיבוש הליכי חקירה. במסגרת החקירה הנוכחית נבחנו חומרי חקירה רבים ונבדק החשד למעורבותם של שותפים נוספים בזיוף המסמך.
בחקירה הנוכחית התחזקה התשתית הראייתית לפיה עבירות הזיוף בנסיבות מחמירות ושיבוש הליכי משפט בוצעו על-ידי הרפז לבדו. נשללה מעורבותם של אשכנזי, בניהו ומי שהיה רל"ש הרמטכ"ל, אל"ם (מיל.) ארז וינר בזיוף המסמך ואף התחזקה הסברה, כי הללו חשבו שמדובר במסמך אותנטי.
שיבוש חקירת פרשת המסמך במסגרת החקירה נחקר חשד לניסיון שיבוש החקירה הנוגעת לזיוף המסמך על-ידי אשכנזי, וינר, מנדלבליט (שהיה אז הפרקליט הצבאי הראשי) ואל"ם (מיל.)
גבי סיבוני.
בחקירה עלה, כי וינר וסיבוני תיאמו גרסאות בסמוך למועד חקירתם בפרשה. עוד נמצא, כי אשכנזי עדכן את מנדלבליט על כך שהמסמך בידיו. למרות שמנדלבליט היה מודע לכך שנפתחה חקירת משטרה וכי מדובר בראיה הדרושה לחקירה הפלילית. הוא לא דיווח על כך, במשך יממה לא הורה לאשכנזי לדווח על כך והעביר מידע שקיבל אודות הפרשה מתוקף תפקידו למעורבים בטרם סיומה. אשכנזי השתהה בדיווח ליועץ המשפטי ולמשטרה על הימצאות המסמך בידיו, למרות שידע על קיומה של החקירה.
נגד אשכנזי התגבשה תשתית ראייתית לביצוע עבירה של הפרת אמונים, וכנגד מנדלבליט התגבשה תשתית ראייתית לביצוע עבירות של הפרת אמונים ושיבוש הליכי משפט. כמו-כן התגבשה תשתית ראייתית נגד וינר וסיבוני לביצוע עבירה של שיבוש הליכי משפט.
שיבוש בדיקת מבקר המדינה בנובמבר 2010 הודיע מבקר המדינה על קיום בדיקה בנושא זיוף המסמך. לקראת בדיקה זו הנחה וינר את אנשי לשכת הרמטכ"ל למחוק פגישות מלו"ז הרמטכ"ל. בשל כך, הוא חשוד בהפרת אמונים.
חשד למסירת מידע מסווג לעיתונאים מהחקירה עלה, כי אשכנזי מסר לעיתונאים מידע ברמת סיווג "סודי ביותר" ולמעלה מסיווג זה, במסגרת תדרוכי עיתונאים ושיחות רקע, זאת בניגוד להנחיות ראש הממשלה ולפקודות הצבא ומבלי שיימצא שיקול ענייני מהותי המצדיק את מסירת חלק מהמידע. בשל כך, הוא חשוד בעבירות של הפרת אמונים וגילוי בהפרת חובה, קרי: גילוי ידיעה לאדם שאינו מוסמך לכך.
חשדות לשיבוש חקירת הדלפה ולהשמדת ראיות בתחילת מרס 2010 הנחה ראש הממשלה,
בנימין נתניהו, את ראש השב"כ, דאז
יובל דיסקין, ואת ראש המלמ"ב, אמיר קין, לחקור חשד להדלפת מידע מסווג לעיתונאי. קין עדכן על כך את אשכנזי, והלה עדכן את וינר. בעקבות זאת תיאמו וינר ובניהו השמדת ראיות ותיאום עמדות. בניהו העביר לאותו עיתונאי מידע על הוראתו של נתניהו.
נגד וינר ובניהו התגבשה תשתית ראייתית לביצוע עבירות הפרת אמונים, השמדת ראיות ושיבוש הליכי משפט. לא התגבשה תשתית ראייתית מספקת נגד אשכנזי וקין. לדעת יצחקי, יש מקום לשקול נקיטת צעדים משמעתיים נגד קין.
החזקת מסמכים מסווגים ביותר בחיפוש שנערך במסגרת החקירה בבתיהם ובמשרדיהם של וינר ובניהו, נתפסו חומרים המסווגים ברמת סיווג "סודי" ולמעלה מסיווג זה, אשר הוחזקו ללא אישור וללא סמכות ולאחר שסיימו את שירותם בצה"ל. חוות דעת הגורמים המקצועיים בצה"ל בנוגע לחומרים שנתפסו קבעה, כי חשיפת המידע המצוי בהם יש בה כדי להוות פגיעה ממשית בבטחון המדינה. בשל כך, חשודים השניים בהתרשלות בשמירת ידיעות שהגיעו לידיהם אגב תפקידם וסיכון ביטחון הידיעה.
איסוף חומר נגד ברק ואנשי לשכתו מהחקירה עלה, כי אשכנזי, וינר, בניהו והרפז עסקו באיסוף חומר שיש בו כדי להטיל דופי בהתנהלותם של ברק ואנשי לשכתו, בין היתר באמצעות הפעלת אחרים. החקירה לא העלתה תשתית ראייתית לביצוע עבירות פליליות בהקשר זה.
תגובות בניהו מסר בתגובה: "אני שמח שחקירת המשטרה הוכיחה באופן ברור שאין כל בסיס לטענות החמורות שעלו בראשיתה בדבר חתירה של הרמטכ"ל נגד הדרג המדיני, חתירה תחת שר הביטחון ברק וכיוצא בזה. כל בר דעת יכול להתרשם היום בעצמו מהפער הבלתי נתפס בין עוצמת החשדות, ההאשמות והפרסומים טרם חקירת המשטרה ובשלביה הראשונים לבין המלצות המשטרה המועברות כעת לעיון הפרקליטות.
"אני משוכנע ומאמין כי לאחר שגורמי הפרקליטות יבחנו ביסודיות את חומרי החקירה ואת ההסברים והגרסאות שניתנו על-ידי במהלכה ולאחר שיופעל שיקול הדעת, יוחלט כי אין מקום להגשת כתבי אישום בפרשה אומללה ומתמשכת זו והתיק ייסגר".