מחלוקת בין התביעה להגנה במשפט נתניהו בנוגע לחיפוש במדיות הדיגיטליות של מנכ"ל וואלה לשעבר, אילן ישועה (תכתובות בטלפון הסלולרי ובדואר האלקטרוני). התביעה טוענת, כי ההגנה מבקשת להגביל את החיפוש רק לתכנים העשויים לסייע לה והיא מבקשת (24.6.21) מבית המשפט המחוזי בירושלים להכריע במחלוקת. הדיונים הופסקו למשך שבועיים כדי לבצע את החיפוש, והמחלוקת עלולה להצריך זמן נוסף ולגרום לדחייה בחידוש הדיונים, הקבוע כעת ל-6.7.21.

בעת החקירה הנגדית של ישועה דיווח סניגורו של שאול אלוביץ, עו"ד ז'ק חן, כי מצא במקרה כמות גדולה מאוד של תכתובות שלא הועברו להגנה. הפרקליטות השיבה, כי מדובר בחומרים שלטעמה לא היו רלוונטיות לחקירה ולכן לא נבדקו. בית המשפט הורה לפרקליטות לבצע בדיקה מקיפה בחומר - 150,000 שורות של תכתובות סלולריות ו-170,000 תכתובות דוא"ל עם 50,0-00 צרופות - ולמסור להגנה עד 28.6.21 את החומרים הרלוונטיים, ובמיוחד אלו הנוגעים לאופן הסיקור של פוליטיקאים ומנהלים בכירים בוואלה.

המנגנון שהוסכם על הצדדים היה מילות חיפוש אותן תקבע התביעה ועליה תוכל להוסף ההגנה, בהתאם לפסיקת בית המשפט העליון כאשר מדובר בכמות גדולה של חומר. אלא שכעת קיימים חילוקי דעות בנוגע למילים ספציפיות, שמאחוריהם מחלוקת עקרונית. ההגנה טוענת, כי הפרקליטות יכולה לחפש רק לפי מילות חיפוש שאינן נוגעות לבנימין נתניהו ומשפחתו - נאמר בבקשת המדינה. לדבריה, ההגנה טוענת כעת שאין לחפש אפילו לפי שמות שכבר עלו בחקירתו של ישועה והיא עצמה אמרה שהם רלוונטיים.

"בבקשתם הנוכחית, כפי שהיא עולה מהתכתובת עם המאשימה, מבקשים הנאשמים הלכה למעשה לכרסם בהחלטת בית המשפט הנכבד ולסגת מן המתווה המוסכם להרחבת החיפוש בהתקני המדיה של העד ישועה. לטעמם, כך נראה, החיפוש שעליו הורה בית המשפט נועד לצרכיהם, ולצרכיהם בלבד", טוענת הפרקליטות. "ולא היא: אכן, החיפוש הנוסף בהתקני המדיה של העד ישועה נולד מבקשתם של הנאשמים והוא לא נועד לשפר את עמדותיה של המאשימה. עם זאת, לאחר שהוכר הצורך בחיפוש נרחב נוסף, לא ניתן לקבל את העמדה שהוא נועד לצרכיה הבלעדיים של ההגנה. החיפוש, כמו כל חיפוש, בין אם הוא נערך בשלב החקירה ובין אם הוא נערך לאחר שהמשפט כבר החל, נועד לצורך גילוי האמת ולא לצורך מטרותיו של צד כזה או אחר".

על-פי ההתכתבות בין התביעה להגנה, סניגורו של נתניהו, עו"ד בועז בן-צור, ביקש (על דעתם של סניגורי אלוביץ) שלא לחפש בין היתר לפי המילים ערן טיפנבורן (אז העורך הראשי של ynet וכיום העורך הראשי של וואלה), ניר חפץ, הבוס, הגדול, בועז סטמבלר ושי חייק (מדובריו של נתניהו), גידי ויץ (עיתונאי הארץ שחשף את פרשה 4000), נתניהו, שרה והגברת. סניגוריתו של נוני מוזס, עו"ד נוית נגב, מתנגדת גם לחיפוש לפי שמו. בקשתה של הפרקליטות הוגשה באמצעות עוה"ד יהודית תירוש, אמיר טבנקין, ניצן וולקן ואסף עיסוק.