הוועד למניעת הרס העתיקות בהר הבית וקבוצה של ארכיאולוגים ידועי שם, אלופים במילואים, אנשי רוח ומשפטנים עתרו (יום א', 9.9.07) לבג"צ לחייב את רשויות השלטון והוואקף המוסלמי להפסיק לאלתר את כל עבודות החפירה שמבצע הוואקף לצורך הקמת תשתיות החשמל במסגד אל-אקצה.
העותרים טוענים, באמצעות עורכי הדין יצחק מירון, דניאל פדר, ברק בר-שלום וישראל כספי, כי הוואקף מפעיל טרקטור בשטח שמצפון וממזרח לרמה של הר הבית, עד למסגד אל-אקצה ולמבנה כיפת הסלע, העומד במקום שבו עמד בית המקדש. הטרקטור חופר תעלה שאורכה כ-500 מטר, רוחבה כמטר ועומקה עד מטר וחצי, וכמות העפר האדירה שהוצאה מהאדמה כ-400 טונות עפר רוויה בממצאים ארכיאולוגיים מתקופות שונות, לרבות מימי בית ראשון ושני, שערכם התרבותי והארכיאולוגי לא יסולא בפז.
בעתירה נטען עוד כי הוואקף המוסלמי מבצע את העבודות בהר הבית בעידוד התנועה האיסלאמית "שמנסה להעלים ולטשטש כל ממצא שיש בו כדי לבסס זיקה יהודית למקום, ובכך להפוך את מתחם הר הבית למקום בעל זיקה וחזקה מוסלמית בלעדית". לדברי העותרים, הוואקף המוסלמי ממשיך להתעלם מהוראות החוק, שלשיטתו המוצהרת הוא אינו כפוף להן, והוא ממשיך לעשות במתחם הר הבית כבתוך שלו, תוך גרימת נזקים בלתי הפיכים לעתיקות הר הבית. העותרים מאשימים את רשויות השלטון, ובכללן רשויות הפיקוח והאכיפה, כי אינם ממלאים אחר ההתחייבות המפורשת שנתנו בעבר לבג"צ ונמנעים מלהפעיל את הסמכויות שהוענקו להם בחוק כדי לאכוף את חוקי התכנון והבנייה וחוקי הארכיאולוגיה וכי במחדליהם "הם נותנים ידיהם להמשך העבירות ולהרס העתיקות. בעתירה נטען כי כי לחפות על מחדליהם ואוזלת ידיהם באי אכיפת החוק ובניסיון להסתיר מעיני הציבור את היקף הנזקים לעתיקות הר הבית, החליטו הרשויות לסגור את מתחם הר הבית לסיקור תקשורתי באופן גורף ומוחלט.
בעתירה צויין כי החפירות גורמות נזק בלתי הפיך לעתיקות ולממצאים ארכיאולוגיים בעלי חשיבות ראשונה במעלה, ומבוצעות שלא כחוק ובלא שניתנו להן האישורים וההיתרים הדרושים.
העותרים דורשים לפתוח את הר הבית לסיקור כלי התקשורת כדי להבטיח את זכות הציבור לדעת על העבודות המתבצעות במתחם הר הבית ועל הנזק הנגרם לעתיקות, שהינם "נכס צאן וברזל ונכס תרבות ראשון במעלה לכל העמים והעדות ולעם היהודי בפרט", כלשון העותרים.
בג"צ גם מתבקש לתת צו ביניים דחוף, שיפסיק יופסק לאלתר את השימוש בטרקטורים ובכלים מכנים כבדים במסגרת עבודות החפירה, וכן למנוע כל עבודה בשעות החשיכה.
העתירה מופנית נגד ראש הממשלה, השרים לביטחון פנים, משפטים, תרבות מדע וספורט, חינוך ודתות, היועץ המשפטי לממשלה, המשטרה, הוועדה המקומית לתכנון ובנייה בירושלים ומנהל רשות העתיקות, וכן נגד הוואקף. הוועד למניעת הרס העתיקות בהר הבית העומד בראש העותרים, הוא גוף א-פוליטי שעימו נמנים בין השאר שני נשיאים (בדימ.) של בית המשפט העליון, מאיר שמגר ומשה לנדוי.
רוב העותרים האחרים הם חברי הוועד למניעת הרס עתיקות הר הבית, ובהם הסופר א.ב. יהושע, מלקולם הונליין, שהוא סגן נשיא ועידת הנשיאים של יהודי ארצות הברית, הפרופסורים לארכיאולוגיה אפרים שטרן, עמי מזר, אהוד נצר, ישראל פינקלשטיין, משה כוכבי, גבי ברקאי ואילת מזר, האלופים במילואים שלמה להט, צבי זמיר, יצחק חופי, יורם יאיר, גיורא איילנד, וד"ר עו"ד שמואל ברקוביץ שחיבר ספר על הר הבית.