חברת נמל אילת סיכמה עם חברת צים כי היא תחזור לפקוד את הנמל, לאחר שבחודש יולי 2007 היא החליטה להפסיק את קו אניות המכולה שהפעילה לעיר. מעתה יגיעו לנמל בין 2 ל-3 ספינות מדי חודש וצוות עובדי הנמל יטפל ב-2,000 מכולות בחודש, כלומר בין 20,000-30,000 מכולות בשנה.
ספינת מכולה ראשונה צפויה לפקוד את הנמל בעוד כחודש. ההחלטה לחדש את ההגעה לנמל התקבלה לאחר מגעים שקיים יו"ר דירקטוריון החברה, עו"ד יאיר חזן, עם מנהלי צים הנמצאת בבעלות החברה לישראל. ספינות המכולה צפויות להגיע מדרום אפריקה וממרכזה, ובימים אלה נבחנת אפשרות לפתיחת קווים נוספים.
ההחלטה להחזרת פעילות המכולות לנמל אילת מחייבת היערכות מיוחדת של הנהלת הנמל בבחינת גיוס כוח אדם נוסף וכן ברכישת ציוד מתקדם ומתאים. יו"ר דירקטוריון חברת הנמל, עו"ד יאיר חזן, ציין כי "זאת התפתחות אסטרטגית ומדובר בבשורה מצוינת לנמל אילת ולצוות העובדים. ניתן יהיה לקבע הסכם זה לטווח ארוך אם המדינה תחזיר לנמל אילת את סיבסוד התובלה היבשתית שאותו הפסיקה בשנת 2006. זאת בשל המרחק ממרכז הארץ. נמל אילת הוא נכס אסטרטגי למדינה, ובכוונתנו לעשות שימוש בתוכניות מגירה הכוללות רכישת ציוד מתקדם ושידרוג הציוד הקיים לשירות מקצועי על-מנת שיוביל לפתיחת קווים נוספים לעיר".
