יומיים אחרי הפיצוץ הראשון, פיצוץ מימן שני אירע הלילה (ב', 14.3.11) בכור הגרעיני בפוקושימה 3, כך דיווחו סוכנויות הידיעות. ליבת הכור לא נפגעה.
לטענת החברה המפעילה את הכור, נמצאו בכור רמות קרינה תקינות ונמוכות בהרבה מן הרמה שבה נדרש דיווח לממשלה. עם זאת, פונו מן האזור כשמונים אלף בני אדם מחשש לדליפת קרינה רדיואקטיבית. זאת לאחר שבימים האחרונים פונו 200 אלף בני אדם ברדיוס של 20 קילומטרים.
הפיצוץ התרחש בבניין שבו נמצא כור מספר 3 בתחנת הכוח הגרעינית שבצפון מזרח יפן. כ-600 עובדים נותרו באזור הפיצוץ, והצטוו לשהות במבנים סגורים.
מן הסוכנות היפנית לאנרגיה אטומית נמסר כי לפחות 11 עובדים נפצעו בפיצוץ. בפיצוץ הראשון שאירע בסוף השבוע בבניין מספר 1 בכור נהרגו שני עובדים.
