המדינה לא הזהירה את הרב הראשי לשעבר, הרב אליהו בקשי-דורון, שהוא עלול להפליל את עצמו בעדותו בבית המשפט בפרשת תארי הרבנות. כך התברר (יום א', 20.1.13) עם פתיחת משפטו של הרב בקשי-דורון.
הרב בקשי-דורון מואשם, כי ידע שהמכללות המעניקות תארי רבנות לאנשי כוחות הביטחון (צה"ל, משטרה, שב"ס) אינן עומדות בתנאים הנדרשים לכך, אך למרות זאת איפשר את הענקת התארים. באמצעות תארים אלו קיבלו מאות מאנשי כוחות הביטחון עשרות מיליוני שקלים במירמה.
התיק נגד הרב בקשי-דורון נסגר בשנת 2007 והודעה על כך אף נמסרה לו, אך לאחר שהעיד במשפטם של מעורבים אחרים - הוא נפתח מחדש והוחלט להעמידו לדין. סניגורו, עו"ד
יעקב וינרוט, העלה טענה מקדמית נגד ההחלטה לנוכח העובדה שהרב לא הוזהר שהוא עלול להפליל את עצמו בעדותו.
שופט בית המשפט המחוזי בירושלים,
צבי סגל, הביע את הסכמתו העקרונית עם טענתו של וינרוט. הוא אמר: "אני מדבר במישור הפרקטי - לא נתקלתי במצב, עד היום, קרוב ל-30 שנה, בו עד תביעה מוסר משהו שעלול להפליל אותו והתובע שותק... אם התובע נמנע מלעשות את זה, מסיבה זו או אחרת, בית המשפט יפנה לתובע. אם בית משפט לא פונה, התובע צריך לפנות לבית המשפט".
סגל הוסיף: "אני מדבר מתוך פרקטיקה של 30 שנה, ועוד מלפני שהייתי שופט. אין מצב שעד תביעה מעיד על משהו שהתובע מצפה ממנו שיעיד ומוסר בגדר עדות משהו שעלול להפליל את עצמו והתובע מחריש ובית משפט מחריש. אין מצב כזה... גם אם טעיתי בניתוח, יש תחושת צדק שצריכה לקנן בין כולנו. אדוני לא צריך להתחיל מאולם בית המשפט אלא עוד קודם. לא להתחיל מהטיעון, יש להסביר לעד שיכול לבקש את זה".
עוד עמד סגל על כך, כי ייתכן שהתובע, עו"ד ארז פדן, יוזמן כעד מטעם ההגנה לנוכח העובדה שהוא אשר תשאל את הרב בקשי-דורון, היה התובע במשפט בו העיד הרב בקשי-דורון ונטל חלק בהחלטה לפתוח מחדש את התיק ולהעמידו לדין. פדן טען שאין בעיה שימשיך לייצג את המדינה, שכן הוא לא יוזמן לעדות, והוסיף: "אני חושב שהתיאור שמדובר בעד שאכזב את התביעה אינו מדויק".
סגל הגיב: "אם אדוני חושב שהוא לא הולך להיות עד, איני יודע מאין הביטחון שלו. חלק מההכרעה בסוגיה היא לא רק מה קרה באולם בית המשפט ויש על כך פרוטוקול, אלא גם מה קרה בראיון המוקדם ומה קרה בהכנה לקראת העדות. אדוני טוען בתשובה שלו, שלא למד על כך בראיון אלא רק בבית המשפט. זו לכאורה עדות".
בסיום הדיון הציע סגל לצדדים לשמוע ראיות בנוגע לטענות המקדמיות של ההגנה, והורה למדינה להגיב על ההצעה עד 24.1.13. את הרב בקשי-דורון מייצג גם עו"ד
ירון קוסטליץ, ואת המדינה - גם עו"ד שירה קני-טל.