מפקדי צבא מצרים הודיעו (יום ד', 3.7.13, שעה 20:00 שעון ישראל) למוחמד מורסי שהוא שוב אינו נשיא מצרים. כך מדווח העיתון אל-אהראם, הנמצא בבעלות ממשלת מצרים. לדיווח זה אין אישור ממקורות אחרים.

דובר הצבא המצרי, קולונל אחמד עלי, הודיע, כי הפגישה בין שר ההגנה, עבד אל-פאתח א-סיסי, לבין בכירים במערכת הפוליטית והדתית הסתיימה. לדברי עלי, הצבא יפרסם הודעה בתוך שעה (עד 22:30 שעון ישראל). גם מוחמד אל-ברדאעי, ממנהיגי האופוזיציה, צפוי לפרסם הודעה.

מהא אבו בקר, מראשי תנועת האופוזיציה "תמרוד", מסר, כי התנועה מציעה את מוחמד גנאים כראש הממשלה לאחר סילוקו של מורסי. גנאים היה ממייסדי המפלגה הסוציאל-דמוקרטית. לדבריו, איש השמאל חוסאם עיסא מיועד לתפקיד סגן ראש הממשלה, וסגן נוסף ימונה משורות המפלגות המוסלמיות.

יועציו של מורסי והאחים המוסלמים טוענים, כי הצבא המצרי מחולל הפיכה וכי טנקים נעים לעבר קהיר. סוכנות הידיעות רויטרס מסרה, כי אנשי צבא מתחו גדרות תיל מסביב למטה המשמר הנשיאותי, בו שוהה מורסי בימים האחרונים - אך לא ברור האם הדבר נועד להכניס אותו למעין מעצר או להגן עליו. דיווחים אחרים טוענים, כי מורסי מצוי למעשה במעצר בית במטה.

דובר משרד החוץ האמריקני אמר כי ארה"ב אינה יכולה לאשר שבמצרים מתחוללת הפיכה צבאית וקרא למורסי לעשות יותר כדי להיענות לדרישות העם. "חזית ההצלה הלאומית", ארגון הגג של האופוזיציה במצרים, הודיע, כי הצבא הבהיר שאינו מתכוון לשלוט במדינה.

מקורות צבאיים הכחישו שמדובר בהפיכה, אם כי אישרו שכלי רכב צבאיים נפרסו באזור ארמון הנשיאות, ליד מרכזם של תומכי מורסי ב"עיר נאצר" וליד כיכר תחריר בה נמשכות ללא הפסק הפגנות הענק נגד מורסי. גם כוחות הביטחון של משרד הפנים הרחיבו את פריסתם ליד הכיכר ובנקודות מפתח נוספות בקהיר. כוחות נוספים נפרסו ליד האוניברסיטה ברובע גיזה, בה התחוללו התנגשויות עקובות מדם ביממה האחרונה, ובגשר המחבר בין גיזה לקהיר.

עלי הכחיש את הידיעות לפיהן הכוחות הפרוסים בקהיר תקפו את המפגינים התומכים במורסי, אשר מרוכזים ליד מסגד רבעה אל-אדווייה בעיר. "הצבא שואף להבטיח ביטחון לכל המצרים, ללא קשר לעמדותיהם. אנו קוראים לתקשורת המקומית והזרה שלא להפיץ שמועות העלולות להציב טריז בין הצבא לעם", הוסיף עלי.

כתב CNN דיווח מקהיר, כי גורמים באחים המוסלמים ובין המפגינים בעד מורסי מדברים על נכונותם למות כדי לשמר את הדמוקרטיה, "אבל נראה שהם לא מבינים את מה שמתרחש. הם לא מבינים שהמפגינים בכיכר תחריר מייצגים את הרוב בעם המצרי".

כוחות הביטחון המצריים המוצבים בסיני נמצאים בכוננות גבוהה מאז שעות הבוקר, וגם בגבול עם עזה חוזקו אמצעי הביטחון. הצבא פרס כוחות בעיר סואץ, ובמחוז כפר אל-שייח שליד הנילוס נפצעו לפחות עשרה בני אדם בהתנגשויות בין תומכי מורסי למתנגדיו. עוד נמסר על מאות אלפי מפגינים נגד מורסי בעיר מנצורה, גם היא בעמק הנילוס.