דוח ועדת שמגר בעניין ניהול מו"מ להשבת שבויים ונעדרים לא יפורסם - קבע סגן נשיא בית המשפט המחוזי בתל אביב, שאול שוחט. הוא קיבל את עמדת מערכת הביטחון, לפיה פרסום הדוח יפגע באינטרסים חיוניים ובמיוחד במאמצים להחזיר מידי חמאס את גופותיהם של הדר גולדין ואורון שאול ואת האזרחים אברה מנגיסטו והישאם שעבאן א-סייד.

התנועה לאיכות השלטון וארגון אלמגור (של נפגעי טרור) טענו בעתירה, כי יש לפרסם את הדוח (שנכתב אחרי הביקורת הציבורית על המחיר הגבוה של עסקת גלעד שליט) על-מנת לעורר דיון ציבורי עליו ולהביא לאימוץ מסקנותיו. שוחט קרא את הדוח ושמע את נציגי מערכת הביטחון, ובראשם הצנזורית הראשית, תת-אלוף אריאלה בן-אברהם, וקבע (11.12.18) שלא נפל פגם בהחלטה שלא להתיר לפרסם אפילו חלקים מתוכו.

בן-אברהם קיבלה את החלטתה לאחר התייעצויות נרחבות, כולל עם שר הביטחון דאז, אביגדור ליברמן, ולא נפל פגם בהפעלת שיקול דעתה - קובע שוחט. בית המשפט אינו ממיר את שיקול דעתה של הרשות בשיקול דעתו שלו, כאשר הרשות פועלת על סמך חוות דעת של מומחים - מזכיר שוחט. הוא גם מצטט את דבריו של הנשיא בדימוס מאיר שמגר, שאמר עם הגשת הדוח שהסודיות היא חלק בלתי נפרד ממנו. שוחט גם דחה את הטענות הפרטניות של העותרות נגד ההחלטה ונגד סירובה של בן-אברהם לפרסם קטעים מתוך הדוח.

לדברי שוחט, בן-אברהם שקלה את כל השיקולים הרלוונטיים ובחנה את טענותיהן של התנועה לאיכות השלטון ושל אלמגור, והחלטתה נותרה בעינה לנוכח חוות דעת מקצועיות עדכניות שהוגשו לה. די בכך שפרסום הדוח יחשוף בפני חמאס את האסטרטגיה הרצויה לניהול מו"מ עימו, כדי למנוע את פרסומו - הוא קובע.

לצד זאת מצטט שוחט את דבריהם של בן-אברהם ושל הממונה דאז על נושא השבויים והנעדרים, ליאור לוטן, לפיהם ניתן יהיה לשקול את פרסום הדוח לאחר השבת הגופות והשבויים שבידי חמאס. הוא מסיים את פסק דינו בהבעת הדעה, לפיה על הממשלה לקיים דיון רציני ומעמיק בהמלצות הדוח שהוגש לה עוד בשנת 2012. את העותרות ייצגו עוה"ד אליעד שרגא ותומר נאור, ואת המדינה - עוה"ד לימור חלד-רון, קרן יוסט ושרה בנו.