יהודה כהן יסיים ב-30.3.20 את תפקידו כמנכ"ל האגודה לבריאות הציבור, יקבל את מלוא הזכויות הסוציאליות ומענק הסתגלות בסך 585,000 שקל. האגודה גם תשלם לעורך דינו 50,000 שקל בעקבות התביעה שהגיש נגדה. כך סיכמו הצדדים (יום ה', 31.10.19) על-פי הצעתה של שופטת בית הדין האיזורי לעבודה בירושלים,
שרה שדיאור.
האגודה הוקמה בשנת 1972 בידי משרד הבריאות ומעסיקה 800 עובדים בשורה של תחומים: סיוע לבעלי מוגבלות, הדרכה ובקרה על בטיחות מזון, גמילה וטיפול בהתמכרויות, טיפול נפשי ובריאות הנפש, ומעבדות לקידום בריאה ואיכות הסביבה. כהן אומר שהוא משמש כמנכ"ל 30 שנה והוביל את העמותה למחזור של 100 מיליון שקל בשנה.
בתביעתו טען כהן, כי הוא הודח משום שהתנגד למהלך מושחת של היו"ר, אידל אלוני: מינוי פיקטיבי של בנו, עו"ד אסף אלוני, ליועץ משפטי של העמותה. בתביעתו חשף כהן דוח חמור במיוחד של מבקר הפנים בעמותה, דן רבין, הטוען שקיים חשש לעבירות פליליות חמורות שבוצעו בה (ראו קישור משמאל).
בתגובתה לתביעה טענה האגודה, כי כהן פוטר משום שניסה למנוע ביקורת עליו ואת שימת הקץ לשלטון היחיד שלו בה. לדבריה, מינויו של אסף אלוני היה לצנינים בעיני כהן, משום שהוא מייעץ לחברי הוועד המנהל ומציג להם זווית שונה משל כהן. אלוני עובד באגודה מזה 8.5 שנים, נוהל בידי כהן עצמו ולמעט היותו בנו של היו"ר - כהן לא הצביע על מעשה פסול כלשהו שלו.
עוד טענה האגודה, כי כהן דרש הפרשי שכר בסך 300,000 שקל שבבדיקה התברר שאינם מגיעים לו. לדבריה, עובדה זו התגלתה רק לאחר שבעצתו של אלוני, דחק הוועד המנהל במבקרי העמותה לבחון לעומק את הדרישה ולהעביר לו חוות דעת מדויקות. עובדה זו, נאמר עוד, גרמה לכהן לצאת נגד אלוני. עוד נאמר בתגובה, כי כהן קיבל לאורך השנים תשלומים שלא הגיעו ושהוא לבדו אישר אותם.
לדברי האגודה, מערך הביקורת בה הפך למשתף פעולה עם כהן, במקום למלא כיאות את תפקידו. במסגרת זו החליט הוועד להחליף את רו"ח טל חסדאי (ששימש כחליף ועדת הביקורת) ברשם העמותות לשעבר, עו"ד
עמירם בוגט - מהלך שכהן התנגד לו בשל קשריו האישיים עם חסדאי. האגודה סיכמה באומרה, כי יחסו המזלזל של כהן, אי-קבלת מרות הוועד המנהל והטעייתה על ידו לא הותירה ברירה אלא לזמנו לשימוע לפני פיטורין.
שדיאור ונציגי הציבור יוחנן בכלר ושלום פישביין נתנו תוקף של פסק דין להסכם הפשרה. את כהן ייצגו עוה"ד
גדעון רובין, אייל לוי ודניאל יחזקאל, ואת האגודה - עוה"ד
אפרת דויטש וגיא בללי.