התנועה לאיכות השלטון מבקשת מבג"ץ (יום ד', 16.6.20) להורות למשטרה לפתוח בחקירה נגד ראש הממשלה, בנימין נתניהו, בפרשת הצוללות, אשר לדבריה קשורה גם לכך שהיו בידיו מניות בחברת הפלדה סידריפט שבשליטת בן-דודו, נתן מיליקובסקי. היא גם מבקשת להורות על הקמת ועדת חקירה ממלכתית וועדת בדיקה ממשלתית בפרשה. למרות בקשתה של התנועה לקיים דיון דחוף בעתירה, בג"ץ הורה להגיש תגובות מקדמיות עד 6.8.20. יצוין, כי בג"ץ אינו נוהג להורות למשטרה לפתוח בחקירה, וכי המשטרה והפרקליטות כבר קבעו שאין מקום לחקור את נתניהו בפרשת הצוללות.

התנועה אומרת כי העתירה מבוססת על שנתיים של איסוף ראיות ומסמכים, כולל תצהירים של בכירים שאת רובם היא מבקשת להגיש בצורה סודית. לטענתה, אנשיה שוחחו עם ראשי ממשלה, שרי ביטחון, רמטכ"לים, ראשי מוסד ושב"כ, קצינים בכירים בצה"ל ועוד. לדבריה, תצהירים אלו מעלים שאלות קשות על הדרך בה הוחלט לרכוש בגרמניה צוללות וכלי שיט אחרים במיליארדי שקלים, ועל הסיבות שהניעו את נתניהו להסכים לכך שאותה מספנה - טיסנקרופ - תמכור צוללות גם למצרים.

לטענת התנועה, החברה שבבעלות מיליקובסקי מוכרת מוצרי פלדה לקונצרן טיסנקרופ, ונתניהו החליט לרכוש צוללות וכלי שיט מקונצרן זה - בניגוד לעמדת מערכת הביטחון - תוך שהוא מצוי בניגוד עניינים. עוד היא טוענת, כי נתניהו רכש 1.7% בחברת סידריפט בהלוואה בסך 600,000 דולר שקיבל ממיליקובסקי - הלוואה שלא נפרעה ועלולה להוות שוחד שמטרתו הייתה להטותו לטובת טיסנקרופ. עוד נטען, כי שווי המניות בפועל באותה עת היה 12 מיליון דולר, וכי גם פער זה מעורר חשש שהמדובר בשוחד. לדברי התנועה, נתניהו מכר בחזרה את המניות למיליקובסקי בשנת 2010 ב-16 מיליון שקל - למרות ששווי החברה נחתך ב-57% בשל המשבר הפיננסי.

עוד אומרת התנועה כי יש לפתוח בחקירה בנוגע לעמלות ששולמו בעסקות כלי השיט שנרכשו על-פי החלטתו של נתניהו בניגוד לעמדת מערכת הביטחון, משום שהללו עלולות להתברר כשוחד. לטענתה, רוב המסמכים והראיות מצויים בידי היועץ המשפטי לממשלה, אביחי מנדלבליט, אשר למרות זאת החליט שלא לחקור את נתניהו בפרשת הצוללות. עוד טוענת התנועה, כי נעשה ניסיון להפריט את מספנות חיל-הים ולהעבירן לידי טיסנקרופ, שוב בצורה המעלה חשש לעבירת שוחד. גם את הסכמתו של נתניהו למכירת הצוללות למצרים - אשר לטענתה נעשתה תוך הסתרתה מעיני כל הגורמים הרלוונטיים - מייחסת התנועה לאותו חשש לשוחד. העתירה הוגשה באמצעות עוה"ד אליעד שרגא, תומר נאור, אריאל ברזילי ואביתר אילון.