לאחר שנים רבות של דיונים ומחלוקות, הכריעה שרת התחבורה מירי רגב כי הפתרון התחבורתי של מעבר קריית המודיעין לנגב יבוצע באמצעות שילוב של רכבת כבדה מתל אביב לבסיס אמ"ן שבליקית, ומשם ברכבת קלה מבאר שבע לליקית. החלטת השרה על הקמת המסילה לבסיסי צה"ל בנגב תאפשר בעתיד חיבור למסילה המזרחית, זאת כחלק מתוכניתה לחיבור ישראל מצפון לדרום.