רשות נחל הירקון, מתריעה על סכנה ממשית לזיהום הירקון בשפכים גולמיים ובקולחים באזור השרון (כפר-סבא, הוד השרון ורמת השרון), בעקבות עבודות תשתית שבוצעו על-ידי מקימי חומת המגן וכביש מס' 6 (כביש חוצה ישראל).
בעקבות ההתרעה (26.8.02), הוזעקו אנשי רשות נחל הירקון למקום, בכדי לטפל בנזקים שנגרמו למתקן הטיפול במי השפכים, המטפל בביוב ומזרים אותו למאגר להשקיה חקלאית.
במסגרת העבודות להקמת כביש חוצה ישראל, נחסם נחל סיר, יובל של נחל קנה ובעקבות החסימה והצפת השטחים הסמוכים, יצא מפעולה המתקן לטיפול וטיהור השפכים. ביוב גולמי החל לזרום לכיוון נחל הירקון מתוך שוחות הביוב של קלקיליה.
רשות נחל הירקון, הקימה סכרים במטרה למנוע את זרימת הביוב אל הנחל, בתקווה שהפעולה תצליח למנוע את הזיהום. בקטע זה של הירקון, חיים דגים רבים ובעלי חיים מימיים נוספים, שהנחל משמש להם בית גידול. בעלי חיים אלה יכולים לחיות רק באיכות מים טובה וכעת ישנה סכנה לחייהם.
מלבד הנזק לנחל, במקרה של זיהום, יהיה צורך לרסס את קטע הנחל מפני יתושים. רשות נחל הירקון נמנעה מריסוס נגד יתושים בתחילת הקיץ מכיוון שלא היה בו צורך: שיפור איכות מי הנחל ונוכחות הדגים בקטע זה מונעים התפתחות יתושים. אולם החשש לזיהום הנחל מאלץ את פקחי הרשות לבצע ריסוס.
המועצה האזורית דרום השרון ורשות נחל הירקון, פנו לחברות חוצה ישראל ודרך ארץ, האחראיות על ביצוע פרוייקט כביש חוצה ישראל, בדרישה לטפל בדחיפות מרבית בנושא.
רשות נחל הירקון תעקוב אחר זרימת הביוב לכיוון הנחל ותמשיך בפעולות למניעת זיהום הנחל.