הממשל האמריקני נוקט באמצעי בטיחות נוספים לאלו הקיימים ומציב צוותי פיקוח בנמליהן של מדינות מוסלמיות, בניסיון למנוע שימוש במטענים להברחת נשק כימי, ביולוגי או אחר לתוך ארה"ב. כך לדברי בכיר רשמי כפי שדווח בניו יורק טיימס.
הפקחים, כך לדברי המקורות, יעזרו במוניטורים מיוחדים ובגלאי כימיקלים וציוד נוסף כדי לאתר מתכות מסוכנות במטען, לפני שזה יגיע לספינות העתידות לעגון בנמלי ארה"ב.
צעדים אלו הם חלק מהתכנית הממשלתית שהחלה זמן קצר לאחר ההתקפות ב-11 בספטמבר, להציב עמדות פיקוח אמריקניות על-מנת לבצע חיפוש אחר נשק לא קונבנציונלי. השלב הראשון של התכנית התמקד ב-20 נמלים באירופה ובאסיה - בהן אוכלוסיה מוסלמית רבה.
גורמים רשמיים אמרו, כי תכניתו של המשרד לביטחון פנים האמריקנים היתה להציב צוותי ביטחון באופן קבוע בדובאי במפרץ הפרסי, מלזיה, טורקיה ומדינות מוסלמיות אחרות. בארה"ב מאמינים, כי חברי הטרור אל-קאעידה מרוכזים בעיקר בדובאי ובמלזיה, כך בטיימס. בנוסף, על-פי מידע מודיעיני אל-קאעידה עשתה שימוש בספינות משא על-מנת להעביר נשק קונבנציונלי וחומרי נפץ, כמו שעשו ב-1998 בהפצצת שנתי שגרירויות אמריקניות במזרח אפריקה.
האמריקנים מודאגים גם ממטען אנושי, כך מדווח הטיימס. באוקטובר 2001, שבועות לאחר ארועי ה-11 בספטמבר, הרשויות בנמל איטלקי עצרו אדם מצרי החשוד כחבר באל-קאיעדה, אשר התחבא בספינת המשא שיעדה הליפקס, בנובה סקושה. על גופו נמצאו מפות ואישורי מעבר. האדם נעלם לאחר ששוחרר בערבות.
