עובדי הרכבת שהיו מעורבים בהשבתת הקו החדש לראשון לציון (משה דיין), לחולון ולבת ים זומנו לבירור מול ועדת המשמעת של
רכבת ישראל. בבירור שהתקיים בערב (יום א', 25.9.11) הוחלט להשעות שמונה מהם. במושעים - שני חברי ועד. ההשעיה תהיה עד לקיום דיון בוועדת הבירור (טרם נקבע מועד לכך). שבעה מבין השמונה כלל לא טרחו להתייצב בפני ועדת המשמעת.
במהלך הדיון היום בבית הדין לעבודה בתל אביב, הציעה השופטת
אפרת לקסר לפעול ברוח פיוס השנה הנכנסת ולא להטיל בשלב זה קנסות אישיים משמעותיים על העובדים האחראים לכאוס. היא החליטה את שהחליטה לאחר שמחזיק תיק התעבורה בהסתדרות אבי אדרי ויושב-ראש הוועד גילה אדרעי התחייבו לכבד לאלתר את הצווים נגדם, וכי אם יעזו שוב להפר צו באופן שיגרום לביזוי בית המשפט, יוטלו קנסות אישיים משמעותיים.
משכך, משכה הרכבת את בקשתה למיצוי הדין עם העובדים ולהשעייתם, כפי שהורה לה שר התחבורה ישראל כ"ץ, והחליטה להסתפק בוועדות משמעת, כאמור.
מהרגע בו ועד עובדי הרכבת החליט להפר את צו ביהמ"ש ולמנוע את הפעלת קו הרכבת החדש לראשל"צ מערב, הורה מנכ"ל החברה בעז צפריר על הפסקת תנועת הרכבות בקו זה, עד לקבלת התחייבות של יו"ר הוועד אדרעי בבית הדין לעבודה כי לא תבצע שיבושים נוספים בקו זה ותביא לפגיעה בציבור הנוסעים.
בהתאם לכך, החל בשעה 14:52 החלו לפעול רכבות הנוסעים בקו ת"א-ראשל"צ מערב ולספק שירות בתחנות החדשות בחולון, בבת ים ובראשל"צ מערב.