שירות הביטחון הכללי ממליץ למשרד החינוך להפסיק לאלתר את התקצוב שמועבר לישיבת "עוד יוסף חי" ביצהר. זאת, בשל מידע מודיעיני שעל פיו רבנים בישיבה מעודדים את התלמידים לפגוע בערבים.

הישיבה, שבראשה עומד הרב יצחק שפירא - מחבר הספר "תורת המלך" המברר באופן הלכתי את התנאים המתירים להרוג גויים - מקבלת מיליוני שקלים בשנה מן המדינה.

בשנת 2009 קיבלה הישיבה לא פחות מ-2,178,000 שקלים בהתבסס על ארבעה סעיפים שונים.

בעקבות מעצר ראש הישיבה בחשד להסתה בספרו הורה המשנה לפרקליט המדינה, עו"ד שי ניצן, לעצור את התקציבים לישיבה. לאחר התערבות חברי כנסת מן הימין הודיע משרד החינוך לישיבה כי הכספים שעוכבו יועברו אליה, אך עד היום הם לא הועברו.

על-פי המידע המודיעיני שהגיע לידי שירות הביטחון הכללי מעורבים תלמידים מן הישיבה בפעולות "תג מחיר" נגד ערבים. בין היתר מדובר על מעורבות בהצתת מסגד בכפר סמוך ליצהר.

"בידי שירות הביטחון הכללי הצטבר מידע רב על אודות תלמידים בישיבות ‘עוד יוסף חי' ו'דורשי ייחודך' [הישיבה הקטנה המופעלת ביצהר, א.ו.] באשר למעורבותם בפעילות בלתי חוקית, חתרנית ואלימה המופנית כלפי פלשתינים וכוחות הביטחון. מהמידע עולה בין השאר כי רבני הישיבה וראשיה מודעים לחלק מהפעילות, אינם מונעים אותה ואף מאפשרים לתלמידים לקחת בה חלק. לאור האמור לעיל העביר השב"כ, בתיאום עם משרד המשפטים, למשרד החינוך את המידע והמלצה לשקול את הפסקת מימון המדינה את הישיבות", נמסר משירות הביטחון הכללי.

מנגד, טען עו"ד יצחק בם, המייצג את ישיבת "עוד יוסף חי", כי השב"כ לא ידע למסור אף שם של חשוד בהתפרעות מלבד שמו של תלמיד שסולק מן ישיבה בגלל בעיות התנהגות. "אנחנו מקווים כי משרד החינוך מפעיל שיקול דעת עצמאי ואינו פועל כמריונטה בידי השב"כ", אמר. עוד ציינו בישיבה כי אם יוחלט על הפסקת המימון - תעתור הישיבה לבג"ץ.