ראש הממשלה,
בנימין נתניהו, הנחה (יום ב', 3.10.11) את ראש השב"כ
יורם כהן לאתר בהקדם את האחראים להצתה בכפר טובא זנגריה שבגליל העליון. צוות משותף למשטרה ולשב"כ כבר הוקם כדי לחקור את הארוע.
"רתחתי מזעם למראה את התמונות המזעזעות", אמר נתניהו. "מקומן אינו במדינת ישראל". לדבריו, מדובר בפעולה שסותרת את ערכי מדינת ישראל. "ערכים אלה קובעים כי חופש דת ופולחן הם ערכים עליונים", דבריו.
ראש האופוזיציה,
ציפי לבני, אמרה בתגובה כי אם אכן מדובר בפעולת "תג מחיר", יש לגנותה בתוקף. "ההנהגה בישראל חייבת לחנך בבית פנימה לערכים השוללים שריפת בתי תפילה כנקמה, ולא להסתפק במאבק על הכרה מבחוץ", אמרה.
השר לביטחון הפנים,
יצחק אהרונוביץ', אמר כי פגיעה במקומות קדושים היא פעולה נפשעת ומתועבת, שאין לעבור עליה לסדר היום.
ח"כ
זהבה גלאון (מרצ) קראה ליועמ"ש
יהודה וינשטיין, לפעול לא רק כנגד המציתים עצמם, שזה תפקידה של המשטרה, אלא לנקוט צעדים כנגד מי שהסית ותידלק את חבית אבק השריפה: "היועמ"ש לא נקף אצבע בעקבות התלונות שלי נגד השור המועד, הרב אליהו, שהסית נגד ערבים, וגרם להתפרעויות כנגד סטודנטים ערבים בצפת. ההצתה היום היא פרי ביאושים של החידלון וההבלגה של היועמ"ש שלא הורה להעמיד לדין את המסית הראשי", אמרה.
מאות מתושבי הכפר טובא זנגריה צעדו אל צומת ראש פינה והפגינו שם במחאה על שריפת המסגד. הם יידו אבנים, אך המשטרה מונעת בעדם מלהמשיך. הידברות מתקיימת עם נכבדי הכפר, שהודיעו מצידם כי יבנו מסגד חדש במקום זה שהוצת.
הקרן למורשת אל-אקצה מסרה כי התקיפה היא פשע מתועב נגד בית האלוהים, ותקיפה חמורה נגד הקדוש למוסלמים. "הממסד הישראלי ופקידיו אחראים לפשע הזה, משום שכאשר פגעו במסגדים או בבתי קברות בשטחים הפלשתינים, איש לא רדף או תפס את הפושעים, והדבר עודד קיצונים יהודיים להמשיך בפשעיהם ללא נקיפות מצפון".
הקרן הודיעה על השבתת בית הספר המקומי ועל קיום הפגנת מחאה אחרי תפילת הצהריים, והאשימה את רבה של צפת שמואל אליהו בהפצת אווירה גזענית.