המחלקה לחקירת שוטרים (מח"ש) פותחת בחקירה פלילית במטרה לברר את החשדות שהועלו בדוח ועדת אור נגד חלק ניכר מהמוזהרים. החלטה על פתיחת חקירה התקבלה בישיבה שהתקיימה בערב (יום ב') במשרד המשפטים, בהשתתפות שר המשפטים יוסף (טומי) לפיד, פרקליטת המדינה עדנה ארבל וראש מח"ש הרצל שבירו.
ועדת אור המליצה לפתוח בחקירה נגד שורה ארוכה של קצינים ושוטרים, בגין עבירות לכאורה ב-10 אירועים שונים, בהם נהרגו ו/או נפצעו ערבים-ישראלים. שני אירועים נוספים מימי המהומות באוקטובר 2000 כבר מצויים בחקירת מח"ש.
בדוח שפרסמה נקבה הוועדה באותם אירועים, ולגביהם קבעה, בין היתר: "לגבי שורה של אירועים המליצה הוועדה על קיום חקירה מטעם המחלקה לחקירות שוטרים במשרד המשפטים, כדי שהרשויות המוסמכות יחליטו אם יש מקום לנקוט הליכים פליליים או אחרים כנגד מאן דהוא בגין מעורבותו באותם אירועים".
לגבי שני אירועים נוספים, קובעת הוועדה, ידוע "לוועדה, כי מתקיימת חקירה של המחלקה לחקירת שוטרים ועל-כן לא היה צורך בהמלצה דומה לגביהם". המדובר, איפוא, בחקירה שתתייחס ל-12 אירועים שונים.
שר המשפטים יוסף (טומי) לפיד מסר, כי פנה לפרקליטת המדינה, עדנה ארבל, כדי ליישם את המלצת ועדת אור. לדבריו, הפרקליטות תצטרך להקים צוות בדיקה, ולהעביר את הנושא בכללותו לחקירת מח"ש.
לפיד מעריך, כי חקירת הפרשה תימשך שנתיים-שלוש לפחות, ומח"ש תיאלץ לחקור מאות אנשים. "תהא זו החקירה הגדולה ביותר בישראל", אמר לפיד, "העסק הזה רק מתחיל".