כראש ממשלת ישראל, אני לא אתן שיפגעו במאות אלפי הישראלים שחיים ביהודה ושומרון, ברמת הגולן ובירושלים - בירתנו המאוחדת. אנחנו לא נקבל שום תכתיבים חיצוניים על הגבולות שלנו. הנושא הזה יוכרע אך ורק במשא-ומתן ישיר בין הצדדים". כך אמר (יום ג', 16.7.13) ראש הממשלה
בנימין נתניהו בתגובה להחלטת האיחוד האירופי.
עוד אמר: "הייתי מצפה ממי שהשלום והיציבות באזור באמת עומדים לנגד עיניו, שיתפנה לדון בנושא הזה אחרי שיפתור בעיות קצת יותר דחופות באזור כמו מלחמת האזרחים בסוריה, או המרוץ של אירן להשיג נשק גרעיני". הודעה זו אינה מפרטת את הצעדים שישראל עשויה לנקוט.
קודם לכן, כינס נתניהו בלשכתו דרגים מקצועיים לדון בהשלכות של החלטת נציבות האיחוד האירופי בנושא ההסכמים העתידיים עם ישראל. בדיון נכחו גורמים מקצועיים, בהם השרים
ציפי לבני, האחראית על הנושא המדיני, שר הכלכלה
נפתלי בנט וסגן שר החוץ
זאב אלקין. הדיון נקבע רק היום, לאחר הפרסומים בתקשורת.
ההתייעצות כונסה בעקבות החלטת האיחוד האירופי לאסור על המדינות החברות בו לקיים שיתוף פעולה ולהעביר מימון, מתן מלגות או מענקי מחקר לגורמים הנמצאים ביהודה ושומרון, במזרחה של ירושלים וברמת הגולן.
ההנחיה החדשה, שהפיצה הנציבות האירופית - הזרוע המבצעת של האיחוד האירופי - קובעת את הפרמטרים לשיתוף פעולה בין האיחוד האירופי והמדינות החברות בו לבין גורמים ישראלים, ממשלתיים ופרטיים, לשנים 2020-2014. היא צפויה להיכנס לתוקף ביום שישי הקרוב.
עוד קובעת ההנחיה התקדימית כי כל הסכם עתידי שיחתם עם ישראל חייב לכלול סעיף שקובע שההתנחלויות אינן חלק ממדינת ישראל הריבונית - ולפיכך הן אינן חלק מההסכם.
שר האוצר
יאיר לפיד אמר בעקבות ההחלטה, כי "ההחלטה האחרונה היא חלק משורה ארוכה של החלטות הגורמות לבידודה של ישראל בעולם. הזמן אינו פועל לטובתנו, וכל יום שבו ישראל אינה נמצאת במו"מ לשלום הוא יום שבו נפגע עוד יותר מעמדנו הבינלאומי".
"עם זאת מדובר בהחלטה אומללה, הנעשית בתזמון גרוע ומחבלת במאמצים שעושה מזכיר המדינה האמריקני
ג'ון קרי להביא את שני הצדדים לשולחן המו"מ. החלטת האיחוד האירופי מאותתת לפלשתינים שאין שום מחיר בינלאומי או כלכלי לסירובם המתמשך לשוב לדיונים, וגורמת להם להאמין שישראל תיאלץ להיכנע ללחץ הכלכלי והמדיני", הוסיף לפיד.