משרד המשפטים מציע להגביל את משך הזמן של חקירות פליליות, כך שברוב המקרים יהיה צריך לסיימן בתוך שנתיים או שלוש. המשרד הפיץ (יום ד', 22.6.16) את תזכיר החוק בנושא.
הדרך החוקית להגבלה היא באמצעות כלי ההתיישנות, שכן מרוץ ההתיישנות להגשת כתב האישום מתחיל ממועד סיום החקירה. המשרד אומר, כי משמעות הדבר היא שניתן להאריך את תקופות ההתיישנות עד אין קץ, על-ידי הימנעות מסיומה של החקירה. התמשכות החקירות, נאמר בתזכיר, גורמת עוול לחשוד ופוגעת ביכולתו להתגונן, מעמעמת את הטעם החברתי והמשפטי של ההענשה ומעכבת את שיקומו של העבריין.
על-פי ההצעה, החקירה בעבירות פשע (שלוש שנות מאסר ומעלה) תימשך לא יותר משלוש שנים, והחקירה בעבירות עוון (עד שלוש שנות מאסר) - שנתיים לכל היותר. משרד המשפטים מסביר את ההבדל בכך שעבירות העוון "לפי טיבן מחייבות בדרך כלל חקירות ארוכות יותר בין היתר בשל מורכבות נשוא החקירה; היקף החומר הרב הנתפס בהן; ריבוי הנחקרים; ריבוי ותחכום החשודים. בנוסף לכך, מתאפיינות חלק מעבירות אלה בגילוי מאוחר של העבירה".
עוד מוצע, כי במקרים חריגים יוסמך היועץ המשפטי לממשלה להאריך את תקופות החקירה - שנה נוספת בעבירות פשע ושישה חודשים בעבירות עוון. כאשר החקירה כוללת מספר חשודים, שלחלקם מיוחסות עבירות עוון ולחלקם עבירות פשע, תימשך החקירה לפי העבירה החמורה יותר.
התזכיר מוסיף וקובע, כי תקופות מסוימות לא ייחשבו לצורך תקופת החקירה המירבית: "פרק הזמן בו נבצר מהמשטרה או רשות חוקרת אחרת לחקור בשל התנהגות החשוד כגון היותו מחוץ לישראל, התחמקותו מהחקירה או מצבו הרפואי והנפשי; פרק הזמן שנבצר מהמשטרה לחקור מטעמים הנוגעים במצבו של החשוד, המתלונן, קורבן או עד מרכזי אחר; פרק הזמן שממועד הגשת בקשה לעזרה משפטית או לסיוע משפטי ממדינה אחרת לצורך חקירה; פרק הזמן בו נמנעה חקירתו של אדם או שלא ניתן להגיש נגדו כתב אישום בשל חסינות". גם פרק הזמן המוקדש ל
שימוע לא ייכלל בחשבון.
לצד זאת, תוארך תקופת ההתיישנות על עבירות חמורות במיוחד. עבירת הרצח לא תתיישן כלל; עבירות אחרות שעונשן המירבי הוא מאסר עולם יתיישנו אחרי 30 שנה במקום אחרי 20 שנה; ועבירות הריגה ונסיון רצח יתיישנו אחרי 15 שנה במקום אחרי עשר שנים כיום. לבסוף נקבע בהצעה התהליך להחלה הדרגתית של החוק, כך שבעיקרון הוא לא יחל על חקירות שיתנהלו עם כניסתו לתוקף. משרד המשפטים מציין, כי ייתכן שיהיה צורך בתוספת משאבים לרשויות החקירה כדי לעמוד בהוראות החדשות.