ראשי כנסיות בישראל הביעו חשש (שבת, 4.8.18) כי "חוק הלאום" שנחקק בשבוע שעבר בכנסת ישראל נועד להכשיר הפקעת קרקעות הכנסייה. לדבריהם, מהלך זה מנוגד להבטחה מפורשת שנתן להם ראש הממשלה,
בנימין נתניהו בחודש פברואר השנה, לאחר שראשי הכנסייה סגרו את כנסיית הקבר בירושלים.
ראש הכנסייה היוונית-אורתודוקסית במזה"ת, הפטריארך תיאופילוס השלישי, אמר כי "הסעיף בחוק הלאום הקובע כי המדינה רואה בפיתוח התיישבות יהודית ערך לאומי, ותפעל על-מנת לעודד ולקדם הקמה וביסוס שלה - נועד לסייע לניסיונות ההשתלטות על אדמות כנסייה בירושלים ובמקומות אחרים. החוק החדש אינו מזכיר את הנוצרים והמוסלמים שהתגוררו בארץ לפני הקמת מדינת ישראל".
הפטריארכיה היוונית-אורתודוקסית מייצגת את הקהילה הנוצרית הגדולה במדינת ישראל. היא בעלת הקרקעות השנייה בגודלה במדינה אחרי רשות מקרקעי ישראל.
הפטריארכיה הלטינית של ירושלים המייצגת את האפיפיור ומחזיקה בנכסים רבים בירושלים ובגליל, מסרה (שבת) כי "חוק הלאום החדש אינו מעניק הגנה וזכויות למיעוטים החיים בישראל ולפלשתינים המתגוררים בשטחי הרשות הפלשתינית".
ההגמון סאני אברהים עזאר, ראש הכנסייה הלותרנית בישראל (שבבעלותה כנסיות אוגוסטה ויקטוריה והגואל בירושלים וכנסיית עמנואל במושבה האמריקנית-גרמנית ביפו), אמר כי "החוק החדש - גזעני ומתעלם מתרומתם החשובה לחברה הישראלית של 1.5 מיליון אזרחים ערבים".
בראשית השנה השביתו ראשי הכנסיות את כנסיית הקבר, לאחר שלכנסת הוגשה הצעת חוק שנועדה לאפשר למדינה להפקיע קרקעות שמכרו הכנסיות בירושלים. השביתה הופסקה לאחר שראש הממשלה הבטיח לראשי הכנסיות כי מעמדן לא ייפגע.