כתרי דמשק - תשעה כתבי-יד עתיקים של התנ"ך שהוברחו מסוריה בידי המוסד בשנים 1995-1993 - יועברו לספרייה הלאומית וינוהלו בידי הקדש ציבורי. כך קובע (17.8.20) שופט בית המשפט המחוזי בירושלים, דוד גדעוני.
הכתרים, כפי שמתאר אותם גדעוני, "הם תשעה כתבי יד מהודרים של התנ"ך או של חלקים ממנו, הכתובים על גבי קלף, בעלי הערות נוסח (מסורה קטנה או גדולה), וחלקם בעלי ציורי מיקרוגרפיה - אותיות זעירות היוצרות קווי מתאר של עיטורים שונים - מרהיבים וברמה אמנותית גבוהה". הם נכתבו במאות ה-15-13 והוחזקו בבתי כנסת שונים בדמשק. הקהילה היהודית בסוריה התחסלה בשנות ה-90 והרב הראשי האחרון שלה, הרב אהרון חמרה, עלה ארצה ב-1994. הוא סייע למוסד בהברחת הכתרים וזכה לתשבחות רבות על מסירותו למען הקהילה ובניה, ומשמש כיום כרב הראשי של יוצאי סוריה בישראל.
הכתרים מצויים בספרייה הלאומית בירושלים מאז הבאתם ארצה, ובשנת 2014 היא ביקשה מבית המשפט לקבוע שהם יוחזקו בידי הקדש ציבורי שהיא תהיה הנאמן שלו. הרב חמרה ביקש להעבירם למרכז המתוכנן בחולון למורשת יהדות סוריה (שטרם הוקם), קהילת יוצאי דמשק בברוקלין תמכה בו, ארגון יוצאי סוריה בישראל תמך בעמדת הספרייה (תוך חשיפת מחלוקות בין חברי הקהילה) וכך גם היועץ המשפטי לממשלה.
לאחר נסיונות ממושכים להגיע להסכמה, שלא עלו יפה, קיבל גדעוני בעיקרה את עמדת הספרייה הלאומית. לא הייתה מחלוקת שיש להכריז על הקדש, אך הרכבו ותנאי פעילותו היו נתונים בחילוקי דעות קשים. גדעוני קיבל את עמדת היועץ המשפטי בנוגע לתשעת נאמני ההקדש: הראשון לציון לשעבר (כיום - הרב
שלמה עמאר), הרב חמרה או רב אחר של יוצאי סוריה שיאשר בית המשפט; נשיא האוניברסיטה העברית (כיום - פרופ'
אשר כהן); נציג של ארגון יוצאי סוריה; נציג של מרכז מורשת ליהודי סוריה ולבנון, הקשור לרב חמרה; שלושה נציגים של הספרייה הלאומית; ומנהל מחלקת השימור בספרייה. גדעוני דחה את בקשת הרב חמרה למנותו ליו"ר הנאמנים והותיר את הבחירה בידי הנאמנים עצמם.
עוד קבע גדעוני, כי הכתרים יוחזקו בידי הספרייה הלאומית וכי הנאמנים יהיו רשאים להוציא אותם ממנה תוך הבטחת מלוא התנאים לשימורם. ההקדש גם יוכל להשאיל כתרים למרכז המורשת בחולון, אם וכאשר יוקם. הנאמנים גם יחליטו האם וכיצד להציג את הכתרים לציבור בספרייה הלאומית, תוך שיביאו בחשבון שאחת ממטרות ההקדש היא לקיים פעילות חינוכית ותרבותית בזיקה אליהם ותוך הנצחת פועלה של הקהילה ותרומתם של הרב חמרה ואחרים להצלתם. הנאמנים גם יהיו מי שיחליטו האם לפרסם מהדורת פקסימיליה של הכתרים.
את הספרייה ייצגו עוה"ד מאיר הלר ואפרת פקר; את המדינה ייצג עו"ד יעקב פונקלשטיין; את הרב חמרה ומרכז המורשת ייצגו עוה"ד רוני בוקעי ואריק גינזבורג; את ארגון יוצאי דמשק ייצג עו"ד יהודה טוניק; ואת יוצאי סוריה בברוקלין - עו"ד נסים חמאוי.