עוד בטרם החליט בג"צ מה יהא עתידם של בתי הכנסת הפזורים ברצועת עזה, אך הקבינט המדיני-ביטחוני כבר החליט כי כוחות צה"ל שנותרו ברצועה יצאו משם במהלך יום שני הקרוב.
קצין בכיר בצה"ל אמר (יום ד', 7.9.05) במהלך דיון בוועדת החוץ והביטחון של הכנסת, כי כוחות צה"ל יוכלו לצאת מרצועת עזה תוך 24 שעות מהרגע שיקבל פקודת הפינוי. גם מפקד אוגדת עזה הצטרף להיערכות על פינוי מהיר של הרצועה, ובמהלך היום אמר: "הדרג המדיני צריך להחליט מתי אנחנו יוצאים ואנחנו נהיה מוכנים לצאת מתי שיגידו לנו, לצורך העניין החל מרגע זה". הוא הוסיף, כי יידרשו מספר שעות כדי להשלים את הפינוי.
צה"ל החל את הכנותיו ליציאה כבר מספר חודשים קודם לביצוע הפינוי בפועל באמצע חודש אוגוסט. בשבוע שעבר ציינו גורמי צבא שונים, כי יותר מ-95% מהתשתיות והציוד
כבר הוצא אל מחוץ לרצועה ורק הציוד החיוני ביותר נשאר בבסיסים ובמוצבים. כחלק מההכנות ליציאה מרצועת הזה הודיעו בצה"ל ובמשרד הביטחון, כי החל משעות הבוקר של יום ה' יסגר מעביר רפיח, בהוראת שר הביטחון, לתנועת פלשתינים, וזאת לתקופה זמנית כחלק מיישום תוכנית ההינתקות.
גם ראש הממשלה, אריאל שרון,
התייחס לנושא ואמר במהלך עם שר החוץ של ספרד, מיגל מורטינוס, כי "ככל הנראה בשבוע הבא לא תהיה יותר נוכחות ישראלית בעזה, לאחר שהצבא יעזוב".
בישיבת הקבינט המדיני-ביטחוני הבוקר (ד') הוחלט להקדים את מועד פינוי רצועת עזה ל-12 לחודש, במקום 15 בספטמבר כפי שנקבע תחילה ופינוי יימשך שלושה ימים.
במערכת הביטחון קיים חשש, כי התגברות מעשי הטרור וכן חוסר השליטה שמגלה הרשות הפלשתינית בשתי היממות האחרונות יובילו לניסיונות גוברים והולכים לפגוע בחיילי צה"ל שעדיין נותרו בתוך הרצועה ולמעשה ממתינים לפקודה לקפל את הציוד האישי ולצאת מהרצועה. קיים גם רצון לסיים את הישארות החיילים ברצועה מבלי להעמידם בפני סיכונים מיותרים בימים האחרונים לנוכחות הישראלית ברצועת עזה.
צה"ל ינסה בכל כוחו ועוצמתו שלא לאפשר לארגוני הטרור להכתיב יציאה תחת אש כאשר המחבלים והצעירים המשולהבים מזנבים בחיילים.