הסתדרות העובדים הלאומית (הע"ל) הודיעה (יום ג', 11.11.14) לארגון כוח לעובדים כי היא חוזרת בה מההודעה על היותה ארגון העובדים היציג בחברת התחבורה הציבורית קווים. במהלך חודש ספטמבר פנתה ההסתדרות הלאומית לבית הדין הארצי לעבודה להכריע בשאלת הארגון היציג בחברה, לאור ההתאגדות הקיימת בכוח לעובדים. כעת חזרה בה הע"ל, בנימוק כי נוכחה כי מתנהל משא-ומתן בין ההנהלה לוועד העובדים המאוגד בכוח לעובדים וכי לא ידעה עליו.
בכוח לעובדים ציינו כי משא-ומתן בין הצדדים מתקיים מאז חודש מרס 2013, וכי הדבר הובהר להסתדרות הלאומית בכתב טרם הפנייה לבית הדין.
בעקבות הפנייה לבית הדין, הגיש כוח לעובדים תגובה הכוללת הוכחות למה שכינה "שיתוף פעול פסול בין הנהלת קווים להסתדרות הלאומית". לבית הדין נמסרט הודעות וואטסאפ והקלטות בהן מורים לכאורה חברי ההנהלה, ובהם סמנכ"ל התפעול בחברה דוד כליף, לאנשי הדרג הזוטר בהנהלה ולנהגים להחתים עובדים להסתדרות הלאומית ולבטל את חברותם בכוח לעובדים.
חבר הוועד ניסן נמני אמר: "עבדנו קשה כדי להקים את וועד העובדים. לא היה לנו ספק שהחיבור בין ההנהלה ללאומית כגוף שמתיימר לייצג עובדים ייכשל ויפה שעה אחת קודם". בכוח לעובדים דוחים את הודעתה של ההסתדרות הלאומית ממנה עולה, כי בכוונתה להמשיך ולנסות לפעול בשטח, למרות המו"מ המתנהל בין ההנהלה לוועד העובדים, ולמרות פסק דין הרכבת, אשר קבע "תקופת מניעות" של שנה לארגון עובדים לערער על יציגותו של ארגון יציג המנהל מו"מ על הסכם קיבוצי.
עוד נאמר כי לאור חומרת התנהלות הנהלת קווים בהתערבות בהתארגנות העובדים בכוונת כוח לעובדים, יימשך הליך בבית הדין האזורי בדרישה לסעדים כנגד ההנהלה לרבות פיצויים עונשיים.
מהסתדרות העובדים הלאומית נמסר בתגובה: "מכתבי הטענות שהוגשו הובררה להסתדרות הלאומית מסכת עובדתית שלא הייתה ידועה לה קודם לכן, לפיה מתנהלים מגעים כלשהם בין כוח לעובדים להנהלת
חברת קווים. זאת, אף שקיים ספק רב אם מגעים אלה מתגבשים לכדי משא-ומתן אפקטיבי ואינטנסיבי כנדרש לפי הדין. ההסתדרות הלאומית התנהלה כפי שהיא מצפה מכל ארגון עובדים אחר לפעול, ובניגוד להתנהלותו של ארגון כוח לעובדים, טענה בפני בית הדין הארצי כי מטעמי נימוס ארגוני ומתוך התנהגות הוגנת וראויה ו
בתום לב, יש ליתן לארגון כוח לעובדים אפשרות למצות את הליך המשא-ומתן. נוכח עמדתה זו הסתיים ההליך בבית הדין הארצי ובכך תרומתה של ההסתדרות הלאומית ליישום הדין, לקידום יחסי העבודה הקיבוציים ולסיומו היעיל של ההליך".
בחברת קווים לא הגיבו ואמרו כי אינם צד בעניין.