בידי מערכת הביטחון נמצאות, ערב יום הכיפורים, לפחות 11 התרעות ממוקדות על כוונות של ארגוני טרור פלשתינים לבצע פיגועים שונים. בין מתווי הפיגועים האפשריים: ירי רקטות לעבר יישובים ישראלים, פיגועי חדירת מחבלים וחטיפת ישראלים. בנוסף להתרעות הממוקדות נמצאות בידי ישראל עשרות התרעות כלליות המעידות על כוונות ארגוני הטרור לבצע פיגועים.
סגר כללי הוטל אמש בחצות על שטחי יהודה ושומרון לרגל יום הכיפורים שיחול הערב. זאת על-פי החלטת שר הביטחון, אהוד ברק, ובהתאם להערכת המצב. הסרת הסגר תתבצע ביום ו' הקרוב בשעה 8:00 בבוקר, בהתאם להערכת המצב.
במהלך החג יורשה מעבר פלשתינים במקרים הומניטאריים, רפואיים וחריגים. כל זאת בכפוף לאישור מנגנוני התיאום והקישור. מצה"ל נמסר כי כוחות צה"ל ימשיכו לפעול על-מנת להגן על תושבי מדינת ישראל, תוך התחשבות במרקם החיים הפלשתיני.
בשל הכוננות הביטחונית החלה המשטרה לפרוס כוחות רבים במרכזי האוכלוסיה הישראלית, בדגש על שווקים, בתי עלמין ובתי כנסת. במקביל הוגברה האבטחה גם סביב נציגויות ישראליות בחו"ל. זאת על-רקע התגברות האירועים האנטישמיים בשנה החולפת ובשל האיומים של חיזבאללה לנקום את חיסולו של עימאד מורנייה.
