אתר הפסולת רתמים הינו האחרון מבין 77 אתרים לא מוסדרים שנסגרו על-ידי המשרד לאיכות הסביבה. על-פי בקשת השר לאיכות הסביבה, צחי הנגבי, המועצה הארצית לתכנון ובניה החליטה בישיבתה האחרונה על סגירת אתר הפסולת רתמים ביום 30.6.2003. כך בעצם התבצעה במלואה בקשת הממשלה בשנת 1993, שטענו כי ישנם אתרי פסולת רבים בלתי מוסדרים ברחבי המדינה. מאז פעל המשרד לאיכות הסביבה וסגר מאות מזבלות פראיות ומזבלות גדולות אשר קלטו פסולת מידי יום.
אתר הפסולת רתמים שהינו האחרון שייסגר, קלט מידי יום כ-2000 טון פסולת.
ההחלטה על סגירת התקבלה בהסכמת כל ראשי הרשויות החברות באיגוד ערים דרום יהודה המפעיל את האתר.
השר לאיכות הסביבה ציין, כי משרדו פועל בשנים האחרונות להסדרת הטיפול בפסולת הביתית, ושיבח את פעולת הצוות המקצועי במשרדו ונציגי איגוד הערים על כך שהגיעו להסכמה על מועד סגירת האתר ומנעו הליך משפטי ממושך.
ראש אגף פסולת במשרד לאיכות הסביבה, אילן נסים ציין, כי עם סגירת אתר רתמים על איגוד ערים דרום יהודה לפעול לשיקום האתר, בין היתר בטיפול בתשטיפים ובגזים הנוצרים כתוצאה מהתפרקות הפסולת. לדבריו, כמויות הפסולת הרבות שהוטמנו באתר לאורך השנים מהוות פוטנציאל רב להיווצרות ביוגז, ומאפשרות הקמת מערכת לניצול הגז להפקת אנרגיה.
