עימות פנים אל פנים שהתקיים בחדר החקירות בין תת-ניצב אפרים ברכה לבין הרב יאשיהו פינטו חושפת יותר מטפחיים מן המתיחות הרבה ששוררת בין שני האנשים שביניהם היו בעבר יחסי מורה רוחני ותלמיד. תמלול העימות, שהתקיים בנובמבר 2012, פורסם על-ידי העיתונאי גידי וייץ באתר הארץ.

העימות נוהל על-ידי מפקד יחידת להב 433 באותם ימים, ניצב מני יצחקי, העומד כיום בראש אגף החקירות של המשטרה. יחד איתו השתתף בחקירה ראש צוות החקירה בפרשה, פקד אסף וולפיש.

פינטו נכנס ראשון לחדר החקירות וקיבל הסבר על האופן שבו יתנהל העימות. "אני אשאל שאלה, אתה תדבר אל אפרים והוא ידבר אליך", אמר לו ניצב יצחקי. בתגובה השיב לו פינטו כי אין לו מה לדבר אל ברכה. אולם למרות דברים אלה, ובסערת רגשות ניכרת הטיח פינטו בברכה דברים קשים:

• 
  פינטו: "אני נתתי (לך) שוחד פעם? ביקשתי ממך משהו תמורת משהו?"
  
  יצחקי: "הרב, הרב..."
  
  ברכה: "הבאת לי כסף".
  
  פינטו: "כמה פעמים הבאתי לך כסף אחרי ושאלתי אותך אם זה מותר לך לקבל? ואמרתי לך: 'תשאל (רשות) מיואב סגלוביץ' (המפקד של ברכה באותה עת)"?
  
  ברכה: "הרב, אתה לא דובר אמת... הרב, הרב".
  
  פינטו: "אתה לא תגיד לי לא דובר אמת, אתה משקר, אתה משקר שקר גדול".
  
  ברכה: "הרב, הרב, הרב..."
  
  פינטו: "אתה שקרן, אתה משקר".
  
  ברכה: "אם הבאת לי אגורה אחת... אגורה אחת..."
  
  המתמלל: "אי-אפשר להבין את שנאמר. פינטו וברכה מדברים ביחד בצעקות".
  
  פינטו: "אני נודר בקב"ה, שאתה לקחת ממני שלוש־ארבע פעמים (כסף)".
  
  ברכה: "הרב, אתה לא יכול לעשות נדר... לא יכול לעשות נדר".
  
  פינטו (צועק): "אתה שקרן, שקר. אני נשבע בספר תורה שנתתי לך 60 אלף דולר".
  
  ברכה (צועק): "שקר!"
  
  פינטו: "שקרן, רמאי, נוכל... אני נשבע בקב"ה... מכונת אמת גם עשיתי".
  
  ברכה: "אני מוכן".
  
  פינטו: "לך תעשה... אתה שפכת את דמי בשביל דרגה".
  
  מני יצחקי: "הרב..."
  
  פינטו: "אל תצעק עלי".
  
  יצחקי: "בואו נירגע".
  
  פינטו (לברכה): "אתה ידעת את מצבה של משפחתי..."
  
  ברכה: "אתה הרסת את עצמך".
  
  ....
  
  פינטו: "אתה שקרן. איך אתה יכול לשקר ככה. תוריד את הכיפה. שקרן".
  
  ברכה: "אתה תוריד! אתה תוריד!"
  
  פינטו: "אם אתה יכול להיות שוטר, זו בושה למדינת ישראל".
  
  ברכה (צועק): "אתה בושה!"
  
  יצחקי: "הרב, הוצאת כבר את כל מה שהוצאת..."
  
  פינטו: "תן לי להירגע".
  
  יצחקי: "תירגע, תירגע. תביאו לו עוד מים".
  
  לאחר שהוקראו בפני פינטו קטעים מעדותו של ברכה שבהם סיפר כיצד לחש פינטו באזניו כי הוא רוצה לתת לו, באמצעות אשתו, 200 אלף דולר, התבקש הרב להישיר מבט לעבר ברכה, שאישר את הדברים, ולהגיב עליהם.
  
  פינטו: "לא רוצה לדבר איתו. כתוב: אסור להסתכל בפני רשע".
  
  יצחקי: "תסתכל עלי. אני לא צד".
  
  פינטו: "חברו נקרא רשע".
  
  ברכה: "האמת, שאני מתבייש שבאתי אליך".
  
  פינטו: "ואני מתבייש שהכרתי אותך... תסתכל לי בעיניים". "לא, אתה משקר בעיניים".
  
  ברכה: "ואתה שחקן גדול".
  
  פינטו: "אני נשבע שנתתי לך 60 אלף דולר".
  
  ברכה: "ולו שקל אחד. אף פעם לא קיבלתי מעטפות מהרב".
  
  פינטו: "אני נודר, אני נודר".
  
  ברכה: "אתה נתת לי כסף?"
  
  פינטו: "נתתי לך כסף".
  
  ברכה: "אתה לא מסוגל להיות רב, לא מסוגל להיות רב".
  
  פינטו: "אתה שקרן ורמאי, נתתי לך ופחדת שאנשים שמעו על זה".
  
  ברכה: "מי שמע? מי שמע? לא יכולים לשמוע, כי זה לא קיים".
  
  העימות הגיע לסיומו. דיאלוג אחרון ופרידה:
  
  ברכה: "עשיתי לך כבוד כרב, חבל לך על הזמן".
  
  פינטו: "אני עשיתי לך כבוד".
  
  ברכה: "הערכה, חבל לך על הזמן".
  
  פינטו: "אתה מדבר על הערכה? תראה מה עשית?"
  
  ברכה: "אתה עשית לעצמך".
  
  פינטו: "אני נשבע שלקחת כסף... תישבע בילדים שלך!"
  
  ברכה: "לא, רגע, אני חייב. אנחנו שנינו הולכים לפוליגרף. על הכסף שנתת לי, אם נתת לי שקל, אני אומר, שקל, כן? אני שם את ראשי תחת גרדום ומוריד אותו... ומתאבד".
  
  פינטו: "לך תעשה את זה".
  
  ברכה: "תתבייש".
  

בשלב זה ביקשו החוקרים מן השניים שיפסיקו לצעוק זה על זה ושיישבו במקומותיהם. זמן קצר לאחר מכן הסתיים העימות.