מנהיג חמאס, השייח' אחמד יאסין, קורא (יום ד', 25.2.04) לבית דין הבינלאומי בהאג, לקבל החלטה נגד גדר ההפרדה. עם זאת, מטיל יאסין ספק ביכולותיו של בית הדין לכפות על ישראל החלטה מעין זו.
עם פתיחת הדיונים בהאג פרסמה תנועת החמאס הודעה רשמית בגנות הגדר, והפצירה בבית הדין הבינלאומי לקבל החלטה העולה בקנה אחד עם החוק והלגיטימיות הבינ"ל. ארגון הג'יהאד האיסלמי הצטרף מאוחר יותר לקריאה זו.
בהודעתה נשבעה החמאס להמשיך במאבק ובפיגועי הטרור עד להפלת הגדר. באחרונה אמרו בכירים בישראל, כי בחמאס מכינים תוכניות מגירה ליום שבו תהפוך הגדר לעובדה מוגמרת. לדברי הגורמים, בתקופה זו, חמאס וארגוני הטרור האחרים ינסו להוציא פיגועים איכותיים יותר, בהתחשב בעובדה שמינון הפיגועים יירד.
השייח' יאסין מבטיח הערב, כי ישראל עוד תגלה שהכספים אשר הושקעו להקמת גדר ההפרדה 'נזרקו לשווא'. "הגדר לא תמנע מהפלשתינים לממש את מטרותיהם... היא לא תעצור את התקפותיהם של לוחמי הג'יהאד בתוך שטח ישראל... פיגועי ההתאבדות לא יופסקו באמצעות הגדר אלא באמצעות הסרת הכיבוש, קרי לאחר שהעם הפלשתיני יהיה חופשי באדמתו, מולדתו ומקומותיו הקדושים".
ראש שירות ביטחון כללי, אבי דיכטר, התריע בישיבת ועדת חוץ וביטחון של הכנסת (יום ג') מכך שהפלשתינים שוקדים כבר עתה על פיתוח ארטילריה עוקפת גדר. במקביל, הביע דיכטר תמיכה רבה בהקמת הגדר והאיץ בזירוז העבודות להקמתה.
