אירגון החמאס העביר ליאסר ערפאת מסר חד-משמעי: לא נצטרף לממשלה בראשותך, במסגרת הרפורמות שבכוונתך להנהיג. המסר מהווה פגיעה ישירה בתקוותו של ערפאת לאחד סביבו את האירגונים החזקים, כדי לגייס תמיכה בעקבות הפגיעה במעמדו לאחר מבצע "חומת מגן".
אחד הצעדים שנטל ערפאת הוא מאבק לשיחרורו של מזכ"ל החזית העממית, אחמד סעדאת. שיחרור זה, מקווה ערפאת, יביא לתמיכה מחודשת בו על-ידי הציבור שמאשים אותו, לפחות חלקית, בבגידה בסעדאת, לאחר שהסגיר אותו בתמורה לשיחרורו מהמוקטעה.
במסגרת הרפורמות, הציע ערפאת לחמאס שתי משרות בקבינט החדש, אולם האירגון דחה את הצעתו. למרות זאת, עשוי ערפאת להציע את המשרות לשני בכירים באירגון, בתקווה שיובילו את האירגון לשנות את דעתו.
רשמית טענו בחמאס כי הרפורמות שמציע ערפאת אינן מספקות, וכי בכוונתם להציע רפורמות מהותיות יותר. מעשית, ניתן להעריך שהם אינם מעוניינים למכור עצמם בקלות, ומקווים להשיג יותר, בעד התמיכה בערפאת - בידיעה שהוא זקוק לה כעת מאוד.
גם הג'יהאד האיסלמי מסרב להצטרף
גם אירגון הג'יהאד האיסלמי דחה לעת עתה הצעה להצטרף לממשל החדש של ערפאת. האירגון לא טרח להסתיר את מניעיו ומסר בהודעה רשמית: "אנחנו לא מתכוונים ליטול חלק בממשל שמראש מוכן לבצע ויתורים לישראלים".
