מליאת הכנסת אישרה אחר-הצהריים (יום ד', 22.2.06) הקמת ועדת החקירה פרלמנטרית אשר תבדוק את אירועי הריסת תשעת הבתים בעמונה. קדימה ומ"מ ראש הממשלה, אהוד אולמרט, הפעילו מאמצים רבים לדחות את הקמת הוועדה, כך נכשלו.
ברוב של 34 חברי כנסת אשר תמכו בהחלטה לעומת 21 שהתנגדו להצעה נקבע, כי ועדת החוץ והביטחון תשמש כוועדת החקירה הפרלמנטרית. ההצבעה במליאת הכנסת התקיימה במהלך דיון מיוחד במליאה.
ביום 8.2.06
החליטה הכנסת על הקמת ועדת חקירה פרלמנטרית. 37 חברי כנסת הצביעו בעד, 32 נגד. לא היו נמנעים. ההחלטה הועברה לוועדת הכנסת לדיון ומשם חזרה חזרה למליאה, והיום, כאמור, הכנסת אישרה באופן סופי את הקמת הוועדה.
יו"ר ועדת החוץ והביטחון של הכנסת, ח"כ יובל שטייניץ, אמר כי ההחלטה מעידה על התחושות הקשות שקיימות בעקבות המספר הרב של הנפגעים וכן "על הספקות שחייבים להתברר לגבי תהליכי קבלת ההחלטות וביצועם בשטח". הוא הוסיף, כי "ועדת החוץ והביטחון תמלא ברצינות ובהגינות המירביים את המשימה שהוטלה עליה על-ידי הכנסת".
יו"ר סיעת המפד"ל, ח"כ שאול יהלום, ציין כי "הכנסת הביעה אי אמון בממשלה ובמשטרה שנתנו את ההוראות לאלימות הקשה בעמונה". לדבריו, "מה שעשתה הממשלה בעמונה היה לא מוסרי ואני מקווה שהוועדה. תחשוף את האחראים על-מנת שהמדינה תמצא איתם את הדין".
בקדימה ציינו ביחס להחלטה: "יש להצטער על כך שביבי והימין הקיצוני ממשיכים לרקוד על דמם של השוטרים והחיילים שנפצעו באירועי עמונה. קואליציה בראשות קדימה בכנסת הבאה תבטל החלטה אומללה זו".
