ארגוני הטרור והגרילה הפלשתינים הגיעו לרמה גבוהה מאוד של תחכום ארגוני על בסיס ביזור יוזמה טקטית ופיקוד אופרטיבי. המנהיגים הבכירים שומרים לעצמם רק את השליטה האסטרטגית. עצמאותן של חוליות הטרור מלמדת שבארגונים אלה אין שרשרת פיקוד במובן הקלאסי של המושג, מן הרמטכ"ל ועד המפקד הזוטר.
חוסר התחכום של ארגונים אלה הוא גם מקור כוחם וסוד הצלחתם: הם מותאמים לשכל הישר של האדם הממוצע. ומכיוון שרוב האנשים הם ממוצעים, גם בציבור הישראלי וגם בציבור הפלשתיני, יש לארגוני הטרור מועמדים רבים לא רק לבצע פיגועים אלא גם לתכנן, ולפקד עליהם.
בארגוני הטרור הפלשתינים, כל מפקד חוליה הוא גם הרמטכ"ל, גם איש הנדסה קרבית, גם ראש אמ"ן וגם ראש אגף ההדרכה ואין הוא חייב דין וחשבון אלא לעצמו. אם הוא יכשל הוא ישלם את המחיר הגבוה ביותר: הוא יחוסל על ידי ישראל או במקרה הטוב: יעבור סדרת חקירות קשה ואחריה יושלך לבית סוהר. באופן שכזה מתבטל הטלפון השבור המבני שבין הפיקוד העליון החוגג תמיד בצבאות קלאסיים, לבין הביצוע, שבין התכנון הבכיר לבין קו הדם, שבין הפרקסיס לבין התיאוריה.
לא לכל מפקד חוליה בחמאס, בג'יאד האסלאמי או בחללי אל-אקצה יש הכישורים האישיים למלא תפקידים אלה ביעילות ולכן גם לא כל מבצע שלהם מצליח. אך המבנה הארגוני הזה מגביר את ההסתברות שיהיו די מפקדי חוליות יעילים כדי לפגוע בישראלים פגיעות כואבות וכדי לגרום לישראל נזקים מוראליים ומדיניים כבדים, עד כדי התפתחות תהליכי התפוררות וקריסה של מערכות רבות בישראל.
הוא מבטיח גם שחיסולים ממוקדים של ראשי הארגונים אינם משפיעים כמעט על יכולת הביצוע, וחיסולים ממוקדים של מפקדים טקטיים אינם פוגעים בארגונים באופן קריטי. חיסולים ממוקדים מועילים לעתים לארגון כי הם מגבירים את המוטיבציה של אנשי השטח. בארגון המבוסס על השכל הישר, מוטיבציה היא אמל"ח אסטרטגי.
שרשרת פיקוד בלתי יעילה היא הכרח מבני, כמעט, של כל מערכת הירארכית, צבאית ואזרחית, והיא מנטרלת, בתחומי הביצוע, את האינטליגנציה, את הגמישות ואת הסתגלנות החיונית כל כך להצלחה ברמת הביצוע; היא מונעת אינטלקטואליזציות של מצבים אמיתיים והופכת את החשיבה למיתולוגית. מטעם זה גם משרד האוצר וגם משרד הביטחון הן מערכות בלתי יעילות.
הפרוסים עמדו על הדילמה הזאת בזמן מלחמות נפוליון והאינטלקטואל הצבאי הגדול ביותר, אולי, בהיסטוריה, הגנרל שארנהורסט קבע שיש לכונן זרוע אינטלקטואלית עצמאית בצבא,שאינה תלויה במפקדי הגייסות, כדי לעצור את שרשרת הפיקוד מלהגיע לדרגת הכסילות הגבוהה ביותר האפשרית.
במלחמת העולם השנייה, כשתכננו הגרמנים את כיבוש האי כרתים בפעולה מוצנחת, הם הנחו את חייליהם לא לפעול לפי פקודות מפקדיהם הישירים (שלא לדבר על המפקדים בעורף) אלא לנהוג כאילו כל אחד מהם הוא מפקד החזית שעליו האחריות להצליח במשימה, כי בקו הדם נשברת שרשרת הפיקוד ובעל הדרגה הבכירה תורם במקרים רבים תרומה שלילית.
הצלחותיו הדרמטיות של המחבל הבין לאומי קרלוס, בשנות השבעים והשמונים, הוכיחו את יתרון אינטליגנציית התא על האינטליגנציה של צבאות מסורבלים ועל שרשרות פיקוד ארוכות ובלתי יעילות. אנשי חוליות החמאס, שלא הוכשרו בשום בה"ד 1 ופו"ם, שלא השתלמו בבתי ספר לטרור בברית המועצות ובמזרח גרמניה, לא רק שהגיעו לדרגה גבוהה של יעילות בלוחמה הזעירה אלא גם חשפו את הליקוי החמור ביותר, אולי, של מערכת הביטחון הישראלית: שרשרת פיקוד ארוכה, שמרנות קיצונית, וסרבול הגורמים להשקעת מאמצי-על בהמשך קיומה של המערכת ותגמול אנשיה, ומונעים ממנה לבצע ביעילות את משימותיה. היום חושבים אנשי מערכת הביטחון הישראלית יותר על קיצוץ הפנסיה שלהם מאשר על לחימה בטרור.
כיוון שאין מהפכה אלא מהפכה אינטלקטואלית, עיון בהצלחת החמאס והג'יהד האסלאמי כשהמעיינים הם בלתי תלויים וכל המקורות הסודיים ביותר חשופים לנגד עיניהם, עשוי לסייע למהפכה האינטלקטואלית שלנו במערכת הביטחון ובמאבק על שרידותה של מדינת ישראל.
מערכת הביטחון היא הזרוע האלימה של המדינה, היא השרירים שלה. שרירים אלה לוקים בניוון מבני מתקדם המונע מהם לא רק למלא את תפקידם ביעילות אלא גם להפיק לקחים ולתקן ליקויים. חשיפת האינטליגנציה של הטרור והשכל הישר של חוליות הטרור עשויה להעמיד לרשותנו מודל לגלות בעזרתו את ליקויינו ולשפר את ביצועינו.