לשגב יש עבר פלילי של מרמה ועבירות סמים

גונן שגב, יליד ינואר 1956, כבר הסתבך בפלילים בעבר - אך לא במשהו שקרוב אפילו לעבירות המיוחסות לו כיום. בתי המשפט בהסתבכויותיו הקודמות ציינו את שקריו כמו גם תאוות הבצע שהדריכה אותו - מה שיכול ללמד על התנהגותו ומניעיו בתיק הריגול המיוחס לו.

בתחילת שנות ה-90 החל שגב לפעול במפלגת צומת, אותה הקים רפאל איתן, ובשנת 1992 נכנס לכנסת. הסיעה הייתה באופוזיציה לממשלתו של יצחק רבין, אך בינואר 1995 הוא הצטרף (עם עמיתיו אלכס גולדפרב ואסתר סלמוביץ) לקואליציה ומונה לשר האנרגיה והתשתית. הוא כיהן בממשלה עד הבחירות הבאות, ביוני 1996. כאשר מואשם שגב, כי סיפק למפעיליו האירניים מידע על משק האנרגיה הישראלי.

לאחר פרישתו החל לעבוד בקבוצת שאול אייזנברג (אז בעלת השליטה בחברה לישראל, כי"ל ובתי הזיקוק) כיועץ לענייני אנרגיה בסין. מהלך זה לווה בביקורת ציבורית חריפה, מאחר שבמהלך כהונתו כשר האנרגיה, ניהל שגב מגעים רבים עם שאול אייזנברג המנוח בענייני אנרגיה, כגון בעניין עתיד הזיכיון של בתי הזיקוק. משטרת ישראל אף פתחה בחקירה בעניין אך התיק לבסוף נסגר.

הסתבכותו הפלילית הראשונה של שגב הייתה כאשר משך 20,000 שקל במכשירי כספומט בהונג-קונג בנובמבר 2003, ולאחר מכן טען שכרטיסו נגנב. הוא הורשע בניסיון לקבל דבר במרמה ובהונאה בכרטיס חיוב ונדון לשנת מאסר על תנאי.

באפריל 2004 נעצר שגב בחשד להברחת אקסטזי לישראל. שגב טען, כי קיבל סוכריות M&M אותן השאיר בתא בשדה התעופה באמסטרדם, ואשר התברר לאחר מכן שהן אקסטזי. שגב הואשם גם בזיוף תוקפו של הדרכון הדיפלומטי שקיבל בעת שכיהן כשר ושאותו אמור היה להחזיר עם סיום תפקידו. במארס 2005 אימץ בית המשפט המחוזי עסקת טיעון, וגזר על שגב חמש שנות מאסר וקנס של 27,500 דולר. הוא שוחרר ביוני 2007 לאחר ניכוי שליש על התנהגות טובה.