דוח חסוי שגיבש האיחוד האירופי קובע, כי ישראל מספחת אליה שטחים במזרח ירושלים, בונה עליהם התנחלויות, הורסת בתים של תושבים פלשתינים במזרח ירושלים, ומסכלת למעשה כל פתרון עם הפלשתינים. כך מפרסם (יום שבת) הגרדיאן הבריטי.
האיחוד האירופי קובע בדוח, כי הוא מכיר למעשה בזכותה של ישראל להגן על ביטחונה, אך הוא אינו מקבל את ניצול הכרה זו לשם סיפוח ירושלים והגדלת ההתנחלויות. מחברי הדוח מאשימים את ישראל, כי מאז ועידת אנאפוליס שהתקיימה בשנת 2007, בנתה ישראל בשטחים עוד 3000 יחידות דיור, ועתה מונה האוכלוסיה היהודית בשטחים כ-190 אלף נפש.
על-פי הדוח הסודי, שחלקים גדולים ממנו פורסמו, ישראל נוקטת מדיניות מפלה לטובת ישראלים וזאת בניגוד לדין הבינלאומי. ישראל מקימה אלפי יחידות דיור בהתנחלויות חדשות, ומקימה מחסומים המונעים מעבר חופשי של פלשתינים במזרח ירושלים ובפאתי העיר. כמו-כן נטען בדוח, כי ישראל הורסת בתים של פלשתינים, סוגרת מוסדות של פלשתינים ומונעת פעילות מצד הרשות ברחבי מזרח ירושלים.
בדוח הסודי נאמר עוד, כי גדר ההפרדה שהוקמה סביב מזרח ירושלים מבודדת את תושביה הערבים, ומונעת התפתחותם הכלכלית. היא מונעת מהם חופש תנועה לעבר שטחי הגדה המערכית, ובמקביל מגבילה את כניסתם לעיר ירושלים.