לאחר הירי הראשוני על האוטובוס התרחש רצף של אירועים נוספים. סיור צבאי שהיה בדרכו לאוטובוס שנפגע עלה על מטען בציר פילדלפי ובאירוע זה נהרג אדם אחד. בוצע גם ירי של פצצות מרגמה ושל טילי נ"ט. מן הירי הזה אין דיווח על נפגעים.

מירי על מכונית פרטית נהרגו ארבעה בני אדם. בירי על מכונית נוספת נפצעו שני ילדי המשפחה. כמו-כן דווח על אוטובוס שרוף.

דובר צה"ל מסר כי יש גם אזרחים שנפגעו וגם חיילים. הוא אמר כי ניתן יהיה לדווח על הרוגים כאשר יימסר המידע למשפחות ההרוגים.

הימ"ם וכוחות מיוחדים של צה"ל ניהלו שעות ארוכות חילופי אש עם שלושה מחבלים והצליחו לחסלם ליד באר אורה. דווח על שבעה מחבלים שנהרגו מתוך כ-20 שהשתתפו בפיגוע המשולב. בכוונת המחבלים היה לחטוף חייל של צה"ל. רשת אל-ג'זירה אף דיווחה כי חייל אכן נחטף, דיווח שהתברר כשקרי.

הקרב התנהל בין כוחות צה"ל בפיקודו של מפקד עוצבת אדום, תת-אלוף תמיר ידעי, לבין המחבלים. הרמטכ"ל רא"ל בני גנץ הגיע למפקדת האוגדה וקיים הערכת מצב ראשונית.

בידי המודיעין היה מידע מוקדם על כוונה לבצע פיגוע בישראל. כוחות של יחידה משטרתית מיוחדת ללוחמה בטרור הוקפצו מבעוד מועד לאילת.