המשטרה הצבאית החוקרת פתחה (ב', 8.5.06), בשיתוף משטרת ישראל, בחקירה בעקבות גניבת תחמושת ממחסן בבסיס תחמושת בבסיס במרכז הארץ.
הכניסה למחנה והפריצה למחסן התגלתה רק הבוקר ובמשטרה הצבאית מנסים לבחון מתי התרחשה הפריצה בפועל. מהבסיס נגנבו כמה מאות כדורי תחמושת קלה, מרביתם כדורי 9 מ"מ וכן חזיזים. משטרת ישראל הוכנסה לחקירה בכדי לבדוק האם מעורבים בה אזרחים או גורמים עבריינים אשר היו מעוניינים בכדורים.
החשש הוא כי התחמושת תשמש למעשי פשיעה בישראל או תועבר לידי גורמי טרור בשטחי הרשות הפלשתינית. בעבר, כבר התרחשו פריצות שונות למחסני ובסיסי צה"ל אשר "הוזמנו" על-ידי גורמים ברשות הפלשתינית כדי להתחמש לביצוע פיגועי טרור נגד ישראל.
במקביל לחקירת המשטרה הצבאית, הורו בצה"ל על הקמת ועדת חקירה בראשותו של קצין בדרגת אלוף משנה.