ועדת וינוגרד לבדיקת תיפקוד הדרג המדיני והצבאי בניהול המלחמה בצפון רק החלה את פעולתה, וכבר יש מי שמבקשים לעצור את פעילותה. התנועה לאיכות השלטון, הנאבקת למן סיום המלחמה על הקמת ועדת חקירה ממלכתית, עתרה לבג"צ (ג', 19.9.06) נגד החלטת הממשלה על מינוי הוועדה כ"ועדת בדיקה".
הממשלה אישרה בישיבתה השבועית (א', 17.9.06) את החלטתו של ראש הממשלה למנות ועדת בדיקה על-פי סעיף 8א' לחוק הממשלה, לבדיקת תפקוד הדרג המדיני והצבאי בניהול המלחמה בצפון ובהיערכות כוחות הביטחון והדרג המדיני להתמודדות עם איום החיזבאללה מאז נסיגת צה"ל מלבנון בשנת 2000.
בוועדה חברים השופט (בדימ.) ד"ר אליהו וינוגרד (יו"ר); פרופ' רות גביזון; פרופ' יחזקאל דרור; האלוף (במיל.) מנחם עינן; והאלוף (במיל.) ד"ר חיים נדל.
בעתירה שהגישה התנועה לאיכות השלטון, באמצעות עוה"ד אליעד שרגא, ברק כלב, צרויה מידד-לוזון ודפנה קירו-כהן, מציינת התנועה, כי "מינוי ועדת בדיקה אינו עולה בקנה אחד עם לשון הדין ותכליתו".
העותרים טוענים, כי בעוד שוועדת חקירה ממלכתית נועדה לשם בדיקת אירועים בהם מדובר בתפקוד רב-מערכתי של זרועות השלטון ובאירוע בעל סדר-גודל לאומי, דוגמת מלחמת לבנון השנייה, הרי שוועדת בדיקה לפי סעיף 8א' לחוק הממשלה, נועדה לחקור כשלים בסדר גודל מוגבל יותר ואף מקומי באופן יחסי, תחת סמכותו של שר מסוים או סמכותם של מספר שרים.
עוד נטען, כי בעוד שוועדת חקירה ממלכתית הינה עצמאית וחבריה ממונים על-ידי גורם נפרד ובלתי תלוי - נשיא בית המשפט העליון, הרי שחברי ועדת הבדיקה הממשלתית מונו על-ידי הממשלה. לפיכך, חברי הממשלה מצויים במצב בולט של ניגוד עניינים כאשר הם מבקשים לשמור לעצמם את היכולת להכתיב את חברי הגוף החוקר אותם.
העתירה מציינת, כי "בנסיבות דנן... אין מנוס מהקמת גוף החקירה המתאים הן מהיבט אופי הסוגיה העומדת לבדיקה, הן באשר למנגנון מינוי חברי הוועדה והן בשל החובה להבטיח כי לרשותו של הגוף החוקר יעמדו כל הכלים הרלוונטיים". התנועה דורשת מבג"צ לבטל את החלטת הממשלה להקים את ועדת הבדיקה בראשות השופט וינוגרד. כמו כן, מבקשת התנועה מבג"צ כי יוציא צו ביניים המורה לוועדת וינוגרד להימנע לפי שעה מזימון עדים ואיסוף ראיות, וזאת עד לבירור העתירה.