ניר רייס נבחר על-ידי ועדת המכרזים לתפקיד סגן בכיר לממונה על השכר והסכמי ההעבודה במשרד האוצר.
במסגרת תפקידו החדש ינהל רייס את המדיניות של השכר במערכת הביטחון, במשרדי הממשלה ובהשכלה הגבוהה.
בשנת 2000 הצטרף רייס לצוות הביטחון של אגף התקציבים, ולקח חלק בהובלת המדיניות הכלכלית והתקציבית של המשרד מול גופי הביטחון והתווית תהליכי שינויים מבניים בתחום. כמו כן שימש רייס גם כרכז ביטחון משרדי ממשלה והשכלה גבוהה באגף השכר והסכמי העבודה שם לקח חלק בתהליכי המשא-ומתן עם נציגי העובדים וההנהלות של הארגונים השונים ואף היה שותף לכל התהליכים הנוגעים לשינויים המבניים במערכת השכר בגופים הביטחוניים.
רייס, בן ה-33, הינו בעל תואר במנהל עסקים, בכלכלה וביחסים בינלאומיים מהאוניברסיטה העברית בירושלים.