שופטת בית המשפט העליון דליה דורנר, הוציאה צו ביניים, המונע כניסת אהוד יתום לתפקיד ראש המטה למלחמה בטרור ויועץ ראש הממשלה אריאל שרון בנושא זה. השופטת חייבה את נציבות שרות המדינה להשיב לעתירה, שתידון בזמן הקרוב.
המינוי נעשה בראשית השבוע (יום א', 9.6.01) על-ידי ראש הממשלה אריאל שרון. בעקבות המינוי הגישו חברי הכנסת יוסי שריד ומוסי רז (שניהם ממרצ) עתירה לבית המשפט העליון, בדרישה למנוע מינוי זה בשל מעורבותו של אהוד יתום בפרשת "קו 300".
העותרים טענו, כי מינויו של יתום אינו סביר באופן קיצוני. הם טענו בעתירה, כי יתום הרג אישית את שני החבלנים שנתפסו חיים, ואף הודה בכך בראיון לעיתון ידיעות אחרונות מלפני כמה שנים.
יתום, לעומת זאת, הצטייד באחרונה במכתב מעיתון ידיעות אחרונות (עליו חתם פרקליט העיתון עו"ד מיבי מוזר) - עימו בא בדברים - שבו נאמר, כי הציטוט שיוחס ליתום, כאילו הוא אמר בראיון וכאילו הודה בראיון ברצח שני המחבלים, בדם קר ובידיו ממש, אינו נכון, וכי הטעות נובעת מאי הבנה מצד הכתב שראיינו.
יתום אמר לעיתונאי שראיינו, כי הוא רואה עצמו אחראי לאותו אירוע, בתוקף תפקידו הבכיר באותו אירוע רלוונטי. ידיעות אחרונות "חגגו" בעת פרסום אותו ראיון - אז זה הוצג בעיתון כהישג עיתונאי ממדרגה ראשונה - ובמשך שנים נמנעו מלתקן את טעותם הגסה. עתה הם נאלצים לתקן טעות זו, בנימוק שנפלה "אי הבנה" בין יתום לבין הכתב.
גם היועץ המשפטי לממשלה נאלץ השבוע להתייחס למינוי זה. רובינשטיין מסר השבוע חוות דעת, לפיה אין מניעות משפטית ממינוי זה, אם כי - תיתכן מחלוקת ציבורית בשאלת נכונותו של מינוי זה.
הצו שהוציא השופטת דורנר יהא בתוקף עד ההכרעה בעתירה. עם או בלי קשר לעתירה, ועוד קודם שהוצא צו ביניים, הודיע ראש הממשלה, לאחר שהתייעץ עם רובינשטיין, כי כניסתו של אהוד יתום לתפקיד מעוכבת עד ההכרעה בעתירה. למרות זאת, כאמור, השופטת דורנר לא הסתפקה בהצהרת כוונות זו והוציאה צו ביניים.