היועץ המשפטי לממשלה, יהודה וינשטיין, ופרקליט המדינה, שי ניצן, עמדו על כך שהרב יאשיהו פינטו לא יעלה במסגרת הסדר הטיעון עימו שום פרטים הנוגעים לקשרי העבר שלו עם תת-ניצב אפרים ברכה. כך טוען פינטו (יום ד', 14.10.14) בתגובתו לבג"ץ על עתירת אומ"ץ, המבקשת להורות למחלקה לחקירות שוטרים לחקור את החשדות נגד ברכה בנוגע לקשריו עם פינטו.

לדברי פינטו, הוא טען כל העת, כי בינו ובין רעייתו דבורה לבין ברכה התקיימו "יחסים מיוחדים במסגרתם היו נתינות של טובות הנאה" עוד לפני אוגוסט 2012 - המועד בו הציע פינטו לברכה שוחד של 200,000 דולר. פינטו אומר, כי הוא שב וביקש שמח"ש תחקור את טענותיו ולא להב 433.

News1 מציין, כי על-פי תגובת המדינה לעתירה - החשדות נגד ברכה נחקרו בלהב 433. הדבר מהווה הפרה ברורה של הכללים החד-משמעיים, לפיהם חשדות נגד שוטרים נחקרים אך ורק במח"ש. במקרה הנוכחי ההפרה בוטה עוד יותר, שכן ברכה שירת קודם לכן בלהב 433 והיה בקשר ישיר איתה בתוקף תפקידו כראש חטיבת המודיעין. בראש היחידה עמד אז מנשה ארביב - שגם נגדו מסר פינטו מידע. יצוין, כי ארביב עצמו נחקר השבוע במח"ש (למרות שכבר פרש מן המשטרה), בעוד ברכה נחקר כאמור בידי להב 433 בעודו עומד בקשר הדוק איתה.

לדברי עורכי דינו של פינטו, אייל רוזובסקי ובת-חן ליפסקי, וינשטיין וניצן סירבו להורות על חקירתו של ברכה בידי מח"ש, ועמדו על כך שלא יעלה בטיעונים לעונש שום טענה הנוגעת לקשרי העבר שלו עם ברכה. פינטו הסכים לחתום על הסדר הטיעון מבלי שעניינו של ברכה נחקר במח"ש והסכים שלא להעלות את קשרי העבר ביניהם. העניין האחרון, נאמר בתגובה, "הוכנס להסדר הטיעון לפי דרישת הפרקליטות כתנאי בל-יעבור".